EBUS-TBNA Proben lassen sich ohne Verlust der diagnostischen Genauigkeit für zytologische und molekulare Analysen teilen
Bibliographic record
Abstract
Hintergrund: Die endobronchiale ultraschall-gestützte transbronchiale Nadelaspiration (EBUS-TBNA) ist eine gängige Methode zum mediastinalen Lymphknotenstaging bei Patienten mit Lungenkarzinom. In den letzten Jahren nehmen molekulare Analysen wie z.B. EGFR-Rezeptor-Mutationsanalysen an EBUS-TBNA Proben zu. In der regulären pathologischen Probenaufarbeitung erfolgen zytologische, histopathologische und immunhistochemische Untersuchungen nacheinander, gegebenenfalls wird eine molekulare Analyse nachgestellt. Bis zum Erhalt des molekularen Analyseergebnisses vergeht daher viel Zeit, zudem werden RNA- und DNA-Qualität und -Quantität durch die Formalinfixierung verringert. Ziel der Studie: Ziel dieser Studie war herauszufinden, ob EBUS-TBNA Proben ohne Verlust der diagnostischen Genauigkeit, um parallel zur histopathologischen Befundung für molekulare Analysen an DNA und RNA genutzt zu werden, geteilt werden können. Materialien und Methoden: Wir haben 249 EBUS-TBNA Proben von 88 Patienten (66 männlich, 22 weiblich) auf Objektträgern mit 1 ml NaCl 0,9% gesammelt und händisch in zwei Hälften geteilt. Eine Hälfte wurde zur pathologischen Untersuchung genutzt, die andere, bevor sie in experimentellem Ansatz zur molekularen Diagnostik verwendet wurde, bei -80°C gelagert. Ergebnisse: Sensitivität (96,6%), Spezifität (100%) und Genauigkeit (97,6%) der pathologischen Diagnostik wurden nicht durch die Probenteilung beeinflusst. An der zweiten Probenhälfte, die zum Erhalt der DNA- und RNA-Qualität und Quantität bei -80°C gelagert wurde, ließen sich molekulare Analysen erfolgreich durchführen. Die separate Aufbereitung des Probenmaterials ermöglicht, molekulare und pathologische Diagnostik parallel durchzuführen. Zusammenfassung: Es ist möglich EBUS-TBNA Proben ohne diagnostische Sicherheit einzubüßen zur zytologischen Befundung und zur molekularen Analyse zu teilen. Durch separate Aufarbeitung beider Probenteile wird Zeit gespart und RNA- und DNA-Qualität und -Quantität werden erhalten.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.003 | 0.005 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.003 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.002 | 0.002 |
| Open science | 0.001 | 0.001 |
| Research integrity | 0.002 | 0.002 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.012 | 0.009 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".