MétaCan
Menu
Back to cohort
Record W2489931825 · doi:10.14279/depositonce-824

New Motifs in DNA Nanotechnology and their Applications

2004· dissertation· de· W2489931825 on OpenAlexfundno aff
Jens Kopatsch

Bibliographic record

VenueDepositOnce · 2004
Typedissertation
Languagede
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Canadian institutionsnot available
FundersYork University
KeywordsNanotechnologyDNA nanotechnologyDNAData scienceComputational biologyBiologyMaterials scienceComputer scienceGenetics

Abstract

fetched live from OpenAlex

Es wurden Versuche mit dem DX-Motiv durchgeführt, um die Mindestlange von Sticky Ends fur das Self-Assembly zu ermitteln. Weiterhin wurden Kristallisationsversuche mit dem TX-Motiv, ausgestattet mit Sticky-Ends, unternommen. Kristallisationsversuche einer TX-Version mit glatten Enden wurden unternommen, um Aussagen über einen eventuell vorhandenen Torsionsstress zu treffen. Von einem Dreiecksmotiv (Chengde-Mao-Dreieck) wurden Gelmobilitätsuntersuchungen von verschiedenen Versionen vorgenommen. Diese Untersuchungen offenbarten möglichen Torsionsstress in einigen der Versionen. Mit drei Helizität-Variationen (Version mit 14nt per innerer Dreiecks-Seitenkante) des Dreiecks wurden Kristallisationsversuche unternommen. Zwei Variationen des Motivs bildeten reproduzierbare Kristalle, die unter Röntgenstrahlen Diffraktion bis zu zehn Angström zeigten. Ein weiteres Dreiecksmotiv, genannt TXDX, bestehend aus einem Dreieck, aufgebaut aus drei versatzverschränkten TX-Motiven, wurde als vielversprechendes Motiv entwickelt. Die Verbindungen zu anderen TXDX-Dreiecken ist über das DX-Motiv realisiert. Ein- und zweidimensionale Felder konnten nach einer Modifikation, die das Self-Assembly auf ein bzw. zwei Dimensionen beschrankt, erzeugt werden. Es sind jeweils drei Variationen für die ein- und zweidimensionalen Felder möglich. Alle wurden erfolgreich erzeugt und mit dem Rasterkraftmikroskop nachgewiesen. Ein rohrartiges Motiv, bestehend aus sechs ca. 30 nm langen DNS-Helices, verbunden durch Überkreuzungen, wurde entwickelt. Dieses Motiv sollte in eine künstliche Membran inkorporieren und als Ionenkanal fungieren. Typisches Ionenkanalverhalten konnte beobachtet werden.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.005
Threshold uncertainty score0.016

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.001
Open science0.0000.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0050.002

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.004
GPT teacher head0.246
Teacher spread0.242 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2004
Admission routes1
Has abstractyes

Explore more

Same venueDepositOnceSame topicAdvanced biosensing and bioanalysis techniquesFrench-language works237,207