Unique cytokine and chemokine patterns in bronchoalveolar lavage are associated with specific causative pathogen among HIV infected patients with pneumonia in Medellin Colombia
Bibliographic record
Abstract
Queriamos investigar el perfil de citoquinas pro-inflamatorias / quimiocinas asociados con los agentes etiologicos identificados en pacientes con VIH. Los pacientes inmunodeprimidos ingresados en dos hospitales en Medellin, Colombia, con diagnostico clinico y radiografico de la neumonia se inscribieron en el estudio. Despues de la autorizacion, se recogio el lavado broncoalveolar (BAL) para bacterias, micobacterias y hongos diagnostico. Todos los pacientes fueron seguidos durante un ano. Una muestra de BAL almacenada se utiliza para la deteccion de citoquinas / quimioquinas y citoquinas medida usando ensayos comerciales humana, basados en perlas magneticas 19-plex. El analisis estadistico se realizo mediante la asignacion de niveles de concentraciones de citoquinas / quimioquinas en 75 percentil (superior). Se llevaron a cabo analisis de componentes principales (PCA) y el analisis de Kruskal-Wallis para identificar la agrupacion de citoquinas con las diversas etiologias infecciosas (hongos, Mycobacterium tuberculosis - BTT, y bacterias). La edad promedio de los pacientes era de 35 anos, de los cuales el 77% eran hombres, y la mediana del recuento de CD4 de 33cells / l. De los 57 pacientes infectados por el VIH, la mortalidad hospitalaria fue del 12,3% y el 33% murio dentro de un ano de seguimiento. El PCA revelo aumento de IL-10, IL-12, IL-13, IL-17, eotaxina, GCSF, MIP-1α, y las concentraciones de MIP-1 beta que se asocia con la infeccion MTB. En los pacientes con infeccion fungica probada, bajas concentraciones de IL-1RA, IL-8, se identificaron TNF-α y VEGF. Las infecciones bacterianas muestran un patron de citoquinas distintas y no fueron mal clasificados utilizando los patrones de citoquinas MTB u hongos (valor de p <0,0001). Nuestros resultados indican un patron unico de citoquinas pro-inflamatorias / quimiocinas, lo que permite la diferenciacion entre patogenos bacterianos y no bacterianos. Por otra parte, encontramos distintas, si, los patrones de citoquinas / quimioquinas imperfectamente discriminatorias asociadas con MTB y las infecciones por hongos
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame distilled prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.
Codex and Gemma teacher scores by category
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.000 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".