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Record W2564405505

Caractérisation du dynamisme microbien du dénitrificateur marin du Biodôme de Montréal

2007· article· fr· W2564405505 on OpenAlexaboutno aff
Normand Labbé

Bibliographic record

VenueEspaceINRS Institutional Digital Repository (Institut National de la Recherche Scientifique) · 2007
Typearticle
Languagefr
FieldEngineering
TopicBiofuel production and bioconversion
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsHumanitiesArt
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

La transcription des symboles et des caractères spéciaux utilisés dans la version originale de ce résumé n’a pas été possible en raison de limitations techniques. La version correcte de ce résumé peut être lue en PDF.La transcription des symboles et des caractères spéciaux utilisés dans la version originale de ce résumé n’a pas été possible en raison de limitations techniques. La version correcte de ce résumé peut être lue en PDF.Dans les aquariums, le taux de nitrate augmente rapidement au-delà de 50 mg-N-N03/L. Le Saint-Laurent Marin du Biodôme de Montréal n'échappe pas à cette accumulation malgré un important système de traitement de l'eau. Afin de diminuer le taux de nitrate élévé, le Biodôme de Montréal a acquis un système de dénitrification en 1998 qui consiste principalement en un reacteur à lit fluidisé alimenté au méthanol. Or, depuis son installation, le système de dénitrification fonctionnait avec une efficacité bien en dessous des prévisions. Il a alors été suggéré que la microflore ne soit pas bien adaptée aux conditions du milieu.La problématique de la dénitrification de l'eau de mer du Biodôme se situe au niveau de la salinité et de la température interne du dénitrificateur qui est de l5-20°C. De plus, le méthanol, utilisable par une faible variété de microorganismes, est utilisé comme source de carbone pour les microorganismes de ce système de dénitrification. L'ajout de métaux traces, tant dans des essais en laboratoire que dans le système de dénitrification, nous a permis d'augmenter le taux de dénitrification de l'ordre de 250%. Cette hausse d'activité des bactéries dénitrifiantes était principalement attribuable au fer. Ce projet visait la caractérisation microbiologique du dénitrificateur marin du Biodôme de Montréal en vue d'une amélioration de l'efficacité du système de dénitrification. La caractérisation des microorganismes impliqués a été effectuée par une approche de microbiologie classique et par une approche de biologie moléculaire (génothèque et électrophorèses sur gel de polyacrylamide en gradient dénaturant (DGGE)). De plus, le rôle et les interactions entre les différentes espèces microbiennes présentes dans le biofilm dénitrifiant ont été étudiés par la technique de l'hybridation in situ fluorescente (FISH) et de la microautoradiographie (MAR).La microflore extraite des supports du réacteur a été cultivée sur trois milieux de culture différents. Trois types de bactéries ont été isolés en culture pure. Ces dernières appartiennent aux genres Hyphomicrobium, Paracoccus et à un nouveau genre bactérien de la famille des Phyllobacteriaceae. Suite à une analyse complète de ce nouvel organisme, nous avons pu publier sa description et le nommer Nitratireductor aquibiodomus. Les bactéries non-cultivées ont été étudiées en constituant une génothèque des gènes de l'ARN l6S ribosomal (ADNr 16S). Le même profil de digestion, à l'aide d'enzymes de restriction, a été retrouvé chez plus de 70% des clones. Les séquences de quelques représentants du groupe le plus abondant ont révélé une affiliation avec le genre Methy/ophaga (gamma-protéobactéries). Le séquençage des clones des autres profils de restriction a révélé des affiliations avec des bactéries dénitrifiantes et des bactéries marines. Suite au remplacement des supports de fluidisation dans le dénitrificateur, la colonisation de ceux-ci a été suivie par PCR-DGGE. Les profils de migration sur DGGE ont évolué pendant les cinq premières semaines puis sont demeurés pratiquement inchangés par la suite.L'étude de la structure du biofilm colonisant dans le dénitrificateur marin du Biodôme de Montréal a été réalisée. L'utilisation de l'hybridation in situ fluorescente a permis de localiser les microorganismes de genre Methylophaga, de genre Hyphomicrobium, de gamma-protéobactéries, d'a/pha-protéobactéries et de protozoaires. \tLes résultats ont montré que les protozoaires recouvraient presque entièrement la surface du biofilm sourtout lorsque le biofilm était jeune et mince. \tDe plus, des micro-colonies d'Hyphomicrobium ont été observées dans le biofilm seulement après trois semaines de colonisation. Les gamma-protéobactéries constituaient la population la plus importante du complexe microbien du dénitrificateur. \tCela corrobore les résultats antérieurs qui montraient les Methylophaga comme le groupe de bactéries dominantes. L'utilisation d'une sonde spécifique aux Methylophaga a indiqué également que ceux-ci étaient les plus abondants dans le dénitrificateur du Biodôme de Montréal. \tCes essais ont aussi montré que les archaebactéries sont absentes du dénitrificateur. À sa maturité, le biofilm contenait environ 57% de Methylophaga, 7% d'Hyphomicrobium et 5% d'eucaryotes.
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\nDes essais de microautoradiographie couplée à l'hybridation in situ fluorescente ont montré que c'était principalement les a/pha-protéobactéries qui assimilaient le méthanol dans des conditions de dénitrification. Les Methylophaga n'ont pas assimilé de méthanol en condition dénitrifiante malgré la forte proportion qu'elles occupaient au sein du biofilm du dénitrificateur.L'étude effectuée a permis de mieux connaître la dénitrification en eau de mer ainsi que les bactéries retrouvées dans un tel écosystème. Elle a aussi contribué à l'amélioration du taux de dénitrification du procédé de dénitrification installé au Biodôme de Montréal. Cette étude, complémentairement à une modification du design du dénitrificateur, devrait permettre un maintien de la concentration de nitrate dans le Saint-Laurent Marin sous la barre des 50 mg N-N03/L.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.007
metaresearch head score (Gemma)0.004
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow), Scholarly communication, Research integrity
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Not applicable · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.791
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0070.004
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.001
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0010.002
Scholarly communication0.0010.002
Open science0.0010.000
Research integrity0.0010.002
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.034
GPT teacher head0.257
Teacher spread0.223 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

Study designNot applicable
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2007
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