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Record W2806400758 · doi:10.71781/31919

Études des mécanismes d’adaptation du métabolisme énergétique dans le syndrome de Leigh de type canadien français : vers l’identification des cibles thérapeutiques

2017· dissertation· fr· W2806400758 on OpenAlexfundaboutno aff
Yvette Mukaneza

Bibliographic record

VenuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2017
Typedissertation
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicDermatological and Skeletal Disorders
Canadian institutionsnot available
FundersCanadian Institutes of Health ResearchFondation du Grand défi Pierre LavoieUniversité de Montréal
KeywordsMedicine

Abstract

fetched live from OpenAlex

Le syndrome de Leigh de type canadien français (LSFC) est une maladie mitochondriale infantile causée par des mutations dans le gène LRPPRC entraînant une diminution tissu-spécifique de la cytochrome c oxydase (COX) et des crises d’acidose lactique fatales qui surviennent lors d’un stress énergétique. Malheureusement, les facteurs sous-jacents à l’apparition de ces crises demeurent inconnus. Ainsi, l’objectif principal de cette étude est de mieux comprendre la physiopathologie du LSFC en investiguant les mécanismes d’adaptation du métabolisme énergétique. Nous avons précédemment démontré que la déficience en COX dans les fibroblastes de patients LSFC était, d’une part, associée à une altération de la phosphorylation oxydative (OXPHOS) alors que ces cellules exhibent des taux d’ATP inchangés. D’autre part, ces cellules LSFC sont plus susceptibles à la mort lorsqu’incubées avec une combinaison de 10 mM de lactate et de 1 mM de palmitate (LP), un modèle de surcharge en nutriments mimant les crises chez les patients. Nous avons alors émis l'hypothèse que, premièrement, les cellules LSFC arboreraient une reprogrammation métabolique sous le contrôle du complexe 1 de la « mamalian Target Of Rapamycin » ou mTORC1, permettant une synthèse extra mitochondriale d’ATP. Deuxièmement, un défaut d’activation du senseur énergétique, la protéine kinase activée par l’AMP ou AMPK, contribuerait à la plus grande susceptibilité des cellules LSFC au LP. Nos résultats montrent qu’en conditions basales la voie Akt/mTORC1/p70-S6K est surexprimée dans les cellules LSFC par rapport aux cellules témoins. Ceci est associé à une augmentation de l’expression du facteur inductible par l’hypoxie (HIF-1α) et de sa cible la pyruvate déshydrogénase kinase 1 (PDHK1), un inhibiteur de l'oxydation mitochondriale des glucides via la PDH1 qui est d’ailleurs inhibée dans les cellules LSFC. En accord avec ces observations, nos résultats métabolomiques montrent que la contribution du glucose à la formation du pyruvate, de l’alanine et du lactate est élevée dans les cellules LSFC comparativement aux cellules témoins. De manière inattendue, l’inhibition de mTORC1 par la rapamycine n’a aucun effet significatif sur l’expression de HIF-1α et de PDHK1, ni sur les taux d’ATP dans les cellules LSFC. Par contre, la rapamycine augmente l’inhibition de PDH1 et réduit l’expression de LRPPRC et de COX dans ces cellules LSFC. Ces données soutiennent pour la première fois une possible régulation de LRPPRC par mTORC1. Nous avons également étudié la voie AMPK en réponse à différents stress. L’AMPK est activable en réponse au 2,4-dinitrophénol aussi bien dans les cellules témoins que les cellules LSFC. Le stress nutritionnel LP ne diminue pas les niveaux d’ATP; mais induit la phosphorylation de l’AMPK, la surexpression de SIRT1, COXIV et LRPPRC dans les cellules témoins. Un prétraitement au ZMP, un analogue de l’AMP et activateur de l’AMPK, augmente encore plus les effets observés avec le LP. Tous ces changements en réponse au LP sont abolis dans les cellules LSFC. De façon intéressante, le traitement de nos cellules avec le 2-bromopalmitate, un analogue non métabolisable du palmitate, n’induit pas la phosphorylation de l’AMPK même dans les cellules témoins. Ces résultats suggèrent que le métabolisme du palmitate est requis pour l’activation de l’AMPK et que celui-ci est altéré dans les cellules LSFC. En conclusion, les cellules LSFC présentent une reprogrammation métabolique de type effet Warburg. mTORC1 ne joue pas de rôle clé dans le maintien de niveaux d’ATP, mais son activation est primordiale pour l’expression de LRPPRC et COX. Par ailleurs, les mécanismes de défense via l’AMPK en réponse au stress, notamment nutritionnel, semblent altérés dans les cellules LSFC.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.963
Threshold uncertainty score0.073

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0010.001
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.182
Teacher spread0.176 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Published2017
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