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Record W2891104835 · doi:10.71781/4075

Caractérisation de la zinc métalloprotéase de Streptococcus suis sérotype 2

2017· dissertation· fr· W2891104835 on OpenAlexfundno aff
Audrey Dumesnil

Bibliographic record

VenueOpen MIND · 2017
Typedissertation
Languagefr
FieldMedicine
TopicStreptococcal Infections and Treatments
Canadian institutionsnot available
FundersNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
KeywordsStreptococcus suisZincBiologyMicrobiologyChemistryGeneticsVirulenceGene

Abstract

fetched live from OpenAlex

S. suis est un important pathogène du porc et un agent zoonotique causant méningites, morts soudaines et chocs septiques. Bien que plusieurs facteurs ont été décrits comme étant impliqués dans la virulence de S. suis, les premières étapes de sa pathogénèse restent peu connues. Parmi ces facteurs, il y a la zinc métalloprotéase de S. suis sérotype 2, qui a été décrite comme une IgA1 protéase ayant un rôle critique dans la virulence de S. suis sérotype 2. De plus, cette protéine a été démontrée comme étant un antigène protecteur dans un modèle murin. Cependant des résultats contradictoires ont été obtenus et l’activité IgA protéase de S. suis sérotype 2 est remise en question. De plus, des études phylogénétiques ont permis de démontrer que la zinc métalloprotéase de S. suis est plutôt homologue à la protéine ZmpC de S. pneumoniae, protéine n’ayant pas d’activité IgA protéase. L’objectif général de ce projet a donc été de caractériser la zinc métalloprotéase de S. suis sérotype 2, afin de déterminer son rôle dans la pathogénèse. Pour ce faire, différentes expériences de clivage et d’activation ont été réalisées avec les cibles de l’IgA protéase et de la protéine ZmpC de S. pneumoniae, soit les IgA1 humaines, la matrice métalloprotéase-9 (MMP-9), la glycoprotéine de liaison à la P-sélectine (PSGL-1) et la mucine 16 (MUC16). Les résultats ont démontré que S. suis sérotype 2 n’a pas la capacité de cliver les IgA1 humaines, confirmant l’absence d’activité IgA protéase de ce pathogène. De plus, S. suis n’est pas capable d’activer MMP-9 et de cliver les ectodomaines de PSGL-1. Cependant, la protéine Zmp de S. suis clive partiellement les ectodomaines de MUC16. Malgré cette fonction, Zmp n’est pas un facteur critique pour la colonisation des voies respiratoires ou pour la virulence de S. suis sérotype 2 dans des modèles murins et porcins d’infection. Comme il a été décrit auparavant, la protéine Zmp est un antigène protecteur et la protection obtenue est fortement influencée par l’adjuvant utilisé. En somme, cette étude a permis de démontrer que S. suis sérotype 2 ne possède pas d’activité IgA protéase et que sa zinc métalloprotéase n’est pas un facteur de virulence critique. Ceci permet donc à nouveau de souligner l’importance de confirmer les rôles associés à des facteurs de virulence critique de S. suis par différentes équipes de recherche mondialement.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.010
Threshold uncertainty score0.019

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0030.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.038
GPT teacher head0.400
Teacher spread0.361 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2017
Admission routes1
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