ОЦЕНКА ПЛЕМЕННОЙ ЦЕННОСТИ БЫКОВ-ПРОИЗВОДИТЕЛЕЙ ГОЛШТИНСКОЙ ПОРОДЫПО КАЧЕСТВУ ПОТОМСТВА В СВЯЗИ С УРОВНЕМ ГОМОЗИГОТНОСТИ ПО STR-МАРКЕРАМ
Bibliographic record
Abstract
На примере популяции голштинизированного чернопестрого и голштинского скота, а именно быковпроизводителей, используемых на территории Московской области, было проведено ретроспективное исследование, направленное на определение уровня гомозиготности по STRмаркерам, с последующей оценкой влияния на основные хозяйственнополезные качества и племенную ценность животных. Произведен расчет генетических дистанций и индекса фиксации с учетом страны происхождения, породной и линейной принадлежности в исследуемой популяции. При анализе использовали 12 пар микросателлитных локусов, с последующим сокращением до 9 пар для расчета уровня гомозиготности:TGLA227, BM2113, ETH10, SPS115, TGLA122, INRA23, BM1818, ETH225, BM1824. Коэффициенты наследуемости основных показателей продуктивности и воспроизводства были следующими: удой за 305 дней лактации (h20,146), массовая доля жира в молоке (h20,170), выход молочного жира (h20,139), массовая доля белка в молоке (h20,142), выход молочного белка (h20,124), количество дойных дней (h20,030), продолжительность сервиспериода (h20,033) и живая масса животного (h20,102).Построен генетический тренд по удою за 305 дней лактации в разрезе лет 19832011гг., отражающий селекционную работу в регионе, выраженную в повышении удоя на 104 кг в среднем за период в 4 года. Отмечен низкий индекс фиксации и значения генетических дистанций между животными с учетом страны их происхождения относительно РФ: Германия (Fst0,004 Nei0,021), Голландия (Fst0,005 Nei0,025), Дания (Fst0,007 Nei0,038), Канада (Fst0,011 Nei0,061). Генетические дистанции по Нею и индекс фиксации между породами относительно чернопестрой голштинской: краснопестрая голштинская (Fst0,01 Nei0,054), чернопестрая (Fst0,023 Nei0,118), холмогорская (Fst0,125 Nei0,438). Отмечено отсутствие дивергенции с незначительной дифференциацией линии Силинг Трайджун Рокит 252803 при попарном сравнении между линиями относительно Рефлекшн Соверинг 198998: Вис БэкАйдиал 1013415 (Fst0,002 Nei0,011), Монтвик Чифтейн 95679 (Fst0,01 Nei0,049), ПабстГовернер882933 (Fst0,019 Nei0,105), Силинг Трайджун Рокит 252803 (Fst0,05 Nei0,248). Наблюдается увеличение однородности в динамике между группами по годам рождения (19832014) от Fst0,015,Nei0,081 до Fst0,05,Nei0,024. On the example of the population of Holsteinized blackandwhite and Holstein cattle, namely: sire used in the territory of the Moscow region, a retrospective study was conducted aimed at determining the level of homozygosity by STR markers, followed by an assessment of the impact on the main economically useful qualities and breeding value of animals.The calculation of genetic distances and fixation index was made taking into account the country of birth sires, breed and linear affiliation in the studied population. In the analysis, 12 pairs of microsatellite loci were used, followed by reduction to 9 pairsfor calculating homozygosity level: TGLA227, BM2113, ETH10, SPS115, TGLA122, INRA23, BM1818, ETH225, BM1824. The heritability coefficients of the main indicators of productivity and reproduction were: milk yield for 305 days of lactation (h2 0.146), fat percent in milk (h2 0.170), milk fat (h2 0.139), protein percent (h2 0.142), milk protein (h2 0.124), days in milk (h2 0.030), days out (h2 0.033) and live body weight (h2 0.102). A genetic trend for milk yield for 305 days of lactation in the context of the years 19832011 was built, reflecting the breeding work in the region, expressed in an increase in milk yield by 104,1 kg. on average for a period of 4 years. A low fixation index and values of genetic distances between animals with regard to their country of birth relative to the Russian Federation were noted: Germany (Fst 0.004 Nei 0.021), Holland (Fst 0.005 Nei 0.025), Denmark (Fst 0.007 Nei 0.038) , Canada (Fst 0.011 Nei 0.061). Genetic distances according to Nei and the fixation index between the breeds relative to the blackandwhite Holstein: redandwhite Holstein (Fst 0.01 Nei 0.054), blackandwhite (Fst 0.023 Nei 0.118), Kholmogory (Fst 0.125 Nei 0.438). No divergence was noted with a slight differentiation of the Sealing TrijunRokit 252803 line with a pairwise comparison between the lines relative to Reflection Sovering 198998: Vis Back Aidial 1013415 (Fst 0.002 Nei 0.011), MontvikChiftain 5679 (Fst 0.01 Nei 0,049) Pabst Governor 882933 (Fst 0.019 Nei 0.105) Sealing Tridegin Rocket 252803 (Fst 0.05 Nei 0.248). There is an increase in homogeneity in the dynamics between groups by year of birth (19832014) from Fst 0.015, Nei 0.081 to Fst 0.05, Nei 0.024.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame distilled prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.
Codex and Gemma teacher scores by category
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.003 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.004 | 0.003 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.004 | 0.002 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.006 |
| Science and technology studies | 0.003 | 0.003 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.002 |
| Open science | 0.007 | 0.003 |
| Research integrity | 0.007 | 0.006 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.022 | 0.018 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; both teacher heads agree on what is shown here.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".