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Record W3011881756 · doi:10.3917/seve1.062.0079

L’errance et l’impasse diagnostiques dans les maladies rares d’origine génétique

2020· article· fr· W3011881756 on OpenAlexaff
Laurence Faivre, Antonio Vitobello, Magali Padre, Sylvie Odent, Laetitia Domenighetti, Gwendoline Giot, Christel Thauvin

Bibliographic record

VenueLes Tribunes de la santé · 2020
Typearticle
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicGenomics and Rare Diseases
Canadian institutionsSNC-Lavalin (Canada)
Fundersnot available
KeywordsMedicineGynecologyHumanitiesPhilosophyPolitical science

Abstract

fetched live from OpenAlex

Plus de 8 000 maladies rares sont répertoriées à ce jour et l’on en découvre de nouvelles chaque mois. 80 % d’entre elles sont d’origine génétique. On considère qu’environ la moitié des patients atteints de maladies rares n’ont pas de diagnostic étiologique précis. Vivre sans diagnostic peut entraîner un parcours médical difficile avec une prise en charge retardée ou non optimisée des personnes touchées, et un risque d’isolement. Un diagnostic peut être la clé qui va débloquer l’accès à des soins médicaux et à des services sociaux efficaces, peut permettre de connaître les risques de transmission, ainsi que plus rarement d’accéder à des possibilités thérapeutiques. En l’absence de diagnostic clinique, l’accès à un diagnostic causal est fortement conditionné par l’accès aux technologies de séquençage haut débit, et en particulier au séquençage de l’exome pour certaines pathologies comme les maladies du développement et la déficience intellectuelle. Le séquençage de l’exome n’est cependant proposé à titre diagnostique que dans quelques centres en France. La mise en place de cette offre diagnostique, pourtant très efficace et inégalable sur le plan du rendement et du délai, a été essentiellement freinée en raison de considérations économiques et éthiques. Plusieurs études emblématiques nationales sont en cours pour répondre aux questions posées. Les Plans nationaux maladies rares (PNMR) 1 et 2 ont mis en place des réseaux de soins pour lutter contre l’errance diagnostique et permettre d’orienter les malades vers des centres experts pouvant porter un diagnostic. Le PNMR3 s’attaque maintenant aux situations d’impasse diagnostique et le Plan France médecine génomique 2025 vise à permettre le séquençage du génome à tout patient concerné.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow)
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Not applicable · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.649
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.009
GPT teacher head0.290
Teacher spread0.281 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

Study designNot applicable
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2020
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