MétaCan
Menu
Back to cohort
Record W3097335026

SAMODEJNO UGOTAVLJANJE BOLEZENSKIH SPREMEMB Z AVTOFLUORESCENČNO BRONHOSKOPIJO

2016· article· sl· W3097335026 on OpenAlexaboutno aff
T. Finkst

Bibliographic record

VenueRepository of the University of Ljubljana (University of Ljubljana) · 2016
Typearticle
Languagesl
FieldMedicine
TopicLung Cancer Diagnosis and Treatment
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsPhysics
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Na podrocju obdelave slik se za razpoznavanje objektov v zadnjih letih vse pogosteje uporablja barvna informacija. Segmentacija oziroma razclenjevanje ter klasifikacija oziroma razvrscanje sta kljucna postopka obdelave slik, pomembna za pravilno dolocanje, analizo in interpretacijo slikovne vsebine. Informacijska vsebina medicinskih slik je kljucnega pomena za odkrivanje in razumevanje normalnih in bolezenskih stanj cloveskega organizma. Kakovost slikovno podprtih medicinski preiskav je v veliki meri odvisna od tehnike zajema slik, interpretacije vsebine slik ter od raziskovalnega oziroma medicinskega okolja, ki vzpodbuja zajemanje slik in njihovo uporabo. Rak na pljucih je ena izmed najpogostejsih vrst raka pri cloveku z najvisjo stopnjo smrtnosti zaradi prepoznega odkritja bolezni v stadiju, ko ni vec operabilen zaradi lokalne in sistemske razsirjenosti. V medicinski stroki se vedno ni dovolj dobre diagnosticne metode, s katero bi lahko bolezen odkrili v zgodnejsi, zacetni fazi bolezni, ko je se možna ozdravitev. Razvoj avtofluorescencne bronhoskopije je obetal najucinkovitejso metodo za zgodnje odkrivanje raka na pljucih in prekanceroz. S postopki in napredkom digitalne obdelave slik v medicini je predvideno, da se bo možnost za napake zmanjsala in s tem celotna diagnoza izboljsala. Namen nase raziskave je povecanje diagnosticne senzitivnosti in specificnosti avtofluorescencne bronhoskopije (AFB) s postopki digitalne obdelave slik ter s strojnim ucenjem prepoznavanja med nemalignimi lezijami in med prekancerozami in rakom na sluznici spodnjih dihalnih poti na AFB slikah. V tej raziskavi smo vkljucili AFB slike bronhialne sluznice, pridobljene na AFB napavi LIFE (Xillix Technology, Vancouver, BC) v Univerzitetnem klinicnem centru (UKCL) na Klinicnem oddelku za pljucne bolezni in alergijo v Ljubljani. Slike smo grupirali v tri pomembne skupine, kot so normalna sluznica, sumljiva podrocja prekanceroze in pljucni rak, pri cemer je na vsaki sliki narejena biopsija in imamo histopatoloski rezultat. V disertaciji predstavljamo razvoj sistema za samodejno ugotavljanje bolezenskih sprememb z AFB in metodologijo za izboljsanje AFB. Raziskali smo, kako uporabiti postopke detekcije in strojnega ucenja za samodejno interpretacijo rezultatov na AFB slikah. Nas cilj je bila izbira kombinacije obeh postopkov, s katerimi smo zgradili celoten model interpretacije rezultatov na omenjenih slikah, ki naj bi izboljsal preiskavo v smeri zgodnejsega odkrivanja pljucnega raka. Model smo zgradili z omenjenima postopkoma na podlagi diagnosticnih podatkov (histopatoloski podatki) in pripadajocih odlocitev specialistov bronhoskopije. Natancnost dolocanja sumljivih podrocij na AFB slikah je bistvenega pomena za nadaljno analizo. V predstavljenem postopku smo poizkusili izboljsati iskanje podrocij s predhodnim filtriranjem AFB slike. Na ta nacin izkoristimo dobre lastnosti neizotropnega filtriranja in Cannyjevega postopka iskanja robov, kot sta neobcutljivost na lokalne slikovne elemente in relativno majhna racunska zahtevnost. Poleg lokalnih majhnih podrocij, ki jih s postopkom lahko izlocimo iz slik, imamo tudi možnost odkrivanja in odstranjevanja morebitnih napak. Sumljiva podrocja prekanceroze in malignoma na AFB slikah smo izbrali iz predhodno razclenjenih slik z uporabo podatkov o normi razclenjevanja (GT) (angl. Ground Truth) in nasim predlaganim postopkom za dolocitev sumljivih podrocij. Primerjali smo dve metodi za dolocitev znacilk. Prva metoda uporablja teksturne znacilke na izbranem podrocju, ki izhajajo iz matrike vezanih verjetnosti sivin (GLCM). Druga metoda pa izhaja iz znacilk na histogramu slike ter Gaussove porazdelitve slikovnih elementov. Za razvrscanje vzorcev med sumljivimi vzorci in vzorci malignoma smo izbrali optimalno množico znacilk, ter uporabili tri razvrscevalnike in sicer naivni Bayes, k-NN razvrsevalnik ter razvrscevalnik z metodo podpornih vektorjev (SVM). Pri slednjem smo dobili najboljse rezultate. Uspesnost binarnih razvrscevalnih postopkov smo merili z razlicnimi merami, kot so natancnost, senzitivnost, specificnost in povrsina pod krivuljo (AUC). Obe metodi težita k temu, da bi izboljsali senzitivnost in specificnost metode z zmanjsanjem lažno negativnih rezultatov kot lasno pozitivnih rezultatov in s tem zmanjsali veliko nepotrebnih biopsij bronhialne sluznice zaradi suma na maligno obolenje. Prva metoda je casovno in racunsko bolj zahtevna od druge. Za primerjavo obeh metod in rezultatov smo uporabili Wilcoxonov test predznacenih rangov. Za preverjanje nicelne hipoteze, da se primerjani metodi v svoji natancnosti bistveno ne razlikujeta, smo izbrali stopnjo zaupanja (_ = 0.05) in poiskali pripadajoco vrednost p. Koncni rezultat, katera je statisticno bolj ucinkovita, pa nam je dalo testiranje statisticnih hipotez. V nasem primeru smo dobili signifikantno vrednost pod vrednostjo zaupanja, kar je potrdilo, da je nasa predlagana metoda ucinkovitejsa. Dobljeni rezultati iz predlaganega in razvitega sistema se izkažejo kot uporabni za samodejno dolocanje tipa bolezni na AFB slikah. Predlagana metoda bo izboljsala diagnosticno natancnost, izboljsala specificnost ter posledicno zmanjsala stevilo nepotrebnih biopsij pri diagnozi malignih podrocij. Predlagani racunalniski sistem za odkrivanje malignih podrocij na AFB slikah bo lahko v veliko oporo preiskovalcem.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.002
metaresearch head score (Gemma)0.004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.029
Threshold uncertainty score0.096

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0020.004
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.001
Meta-epidemiology (broad)0.0010.001
Bibliometrics0.0020.002
Science and technology studies0.0020.002
Scholarly communication0.0060.004
Open science0.0010.003
Research integrity0.0020.002
Insufficient payload (model declined to judge)0.0290.004

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.008
GPT teacher head0.182
Teacher spread0.174 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2016
Admission routes1
Has abstractyes

Explore more

Same venueRepository of the University of Ljubljana (University of Ljubljana)Same topicLung Cancer Diagnosis and TreatmentFrench-language works237,207