Genetische und diagnostische Charakterisierung einer großen israelischen PCD-Kohorte – Notwendigkeit der geografischen Anpassungen der aktuellen diagnostischen Leitlinien?
Bibliographic record
Abstract
Hintergrund Die Primäre Ciliäre Dyskinesie (PCD) ist eine genetisch und klinisch heterogene Erkrankung, die durch eine Dysfunktion motiler Zilien gekennzeichnet ist. Die Diagnose der PCD basiert auf verschiedenen Tests, inklusive der Messung von nasalem Stickstoffmonoxid (nNO), Hochgeschwindigkeits-Videomikroskopie (HSVM), Transmissionselektronenmikroskopie (TEM), Immunfluoreszenzmikroskopie (IF) und genetischer Analyse. Methoden Genetische Charakterisierung einer großen israelischen Kohorte mit klinischem Vd. a. PCD (Referenzstandard), um die Testsensitivität der weiteren diagnostischen Methoden (nNO, HSVM, TEM, IF) als Indextests zu bestimmen. Ergebnisse Bei 128 von 185 genetisch analysierten Personen wurden bi-allelische krankheitsverursachende DNA-Varianten in 26 PCD-assoziierten Genen identifiziert (69%). Die meisten Varianten traten in dem Gen DNAH5 auf, gefolgt von CCNO und DNAH11 . Die Ergebnisse der Indextests waren in unterschiedlichem Maße uneindeutig (Genetik 0%; nNO 0%; HSVM 25%; TEM 24%; IF 22%). Die Sensitivität der Tests lag bei 0,85 (HSVM), 0,65 (TEM), 0,71 (IF) und 0,85 für den derzeit empfohlenen Grenzwert von 77 nl/min für die nNO-Produktionsrate (Subgruppenanalysen für PCD mit normaler Ultrastruktur: 0,70). Der optimale diagnostische nNO-Cutoff für diese Kohorte war 132 nl/min (Testsensitivität für PCD mit normaler Ultrastruktur: 0,88 (Gesamtgruppe 0,94)). Diskussion In dieser genetischen Studie wurden krankheitsverursachende Varianten bei Individuen identifiziert, die durch die Messung der nNO-Produktionsraten (Cutoff 77 nl/min, 15%), TEM (51%), IF (47%) und HSVM (39%) übersehen worden wären. Unsere Ergebnisse zeigen, dass eine Anpassung der derzeitigen diagnostischen Leitlinien mit einer Priorisierung der genetischen Analyse und die Verwendung eines höheren nNO-Cutoffs die Diagnose einer PCD mit normaler Ultrastruktur in Israel verbessern kann. Danksagung Wir danken den Betroffenen und ihren Familien für die kontinuierliche Unterstützung. Diese Arbeit wurde unterstützt von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG OM6/7, OM6/8, OM6/10, OM6/14 und CRU 326 (Omran, Raidt), OL450/1 (Olbrich)) und vom IZKF Münster (Om2/009/12, Om/015/16, Om2/010/20) sowie dem „Chief Scientist Office“ des Gesundheitministeriums in Israel (grant no. 3–6176). Publication History Article published online: 09 March 2023 © 2023. Thieme. All rights reserved. Georg Thieme Verlag Rüdigerstraße 14, 70469 Stuttgart, Germany
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How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.002 | 0.005 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.002 | 0.001 |
| Open science | 0.001 | 0.000 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.006 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".