Dispersal and adaptation of two invasive wild carnivores in the Caribbean islands, the Northern raccoon and the small Indian mongoose

La déstabilisation des écosystèmes à travers l’introduction d’espèces exotiques est une des causes majeures de l’érosion de la biodiversité. Les écosystèmes insulaires, dont font partie de nombreux hotspots de biodiversité, sont particulièrement menacés par les invasions biologiques. Illustrant cette tendance globale, la région des Caraïbes a subi un déclin majeur de sa biodiversité conséquemment aux différentes vagues de colonisation humaine, et l’augmentation de l’introduction d’espèces exotiques. Notamment, deux carnivores sauvages ont été introduits dans les Caraïbes durant le 17e et le 19e siècle : le raton-laveur commun, Procyon lotor, et la petite mangouste Indienne, Urva auropunctata. Cependant, nos connaissances de l’histoire de l’introduction de ces espèces, ainsi que notre compréhension de l’influence de l’environnement sur leur distribution restent très incomplètes.Les analyses ADN que nous avons mené durant cette thèse mettent en lumière l’origine géographique des populations introduites de raton-laveurs et de petite mangouste Indienne dans les Caraïbes. Alors que les populations de raton-laveurs des Bahamas trouvent leur origine de deux sources différentes en Floride, les populations présentes aux Antilles ont très probablement été introduites depuis les du Nord et de l’Est des Etats-Unis et du Canada. Nos analyses génétiques des populations de petite mangoustes Indiennes confirment plusieurs évènements d’introduction rapportés dans les registres historiques, mais offrent également un nouvel aperçu sur la dispersion de l’espèce dans la région des Caraïbes, suggérant de nouveau scénarios d’introductions pour les populations dont la documentation est incomplète voire absente. De plus, nos données microsatellites ont révélé une forte structuration des populations des Antilles, suggérant que la dispersion de l’espèce dans ces systèmes insulaires est contingente à l’actiondirecte de l’Homme. L’influence de facteurs environnementaux sur la distribution de ces deux espèces a été étudié à la fois à l’échelle globale, mais également à l’échelle des Caraïbes. Les modélisations de niche environnementale révèlent de vastes régions au climat actuellement favorable au raton-laveur et à la petite mangouste Indienne à l’échelle globale. De plus, les prédictions réalisées à l’horizon 2050 mettent en évidence de vastes région nouvellement favorables au nord des régions qui leur sont actuellement favorables, particulièrement en Europe, où des populations de ces deux espèces sont actuellement en expansion. À une échelle plus locale, nos observations et nos modélisations mettent en lumière la capacité du raton laveur et de la petite mangouste Indienne à évoluer dans une grande diversité d’habitats des iles desCaraïbes. De plus, nos analyses de co-occurrence spatio-temporelle avec d’autres espèces d’oiseaux et de mammifères de Guadeloupe et de Martinique révèlent la menace que représente la prolifération de ces deux espèces, et en particulier la petite mangouste Indienne, pour la biodiversité de ces iles.Enfin, notre étude des variations morphologiques du crâne de la petite mangouste indienne a mis enévidence une différence significative de la taille et de la forme, à la fois du crâne et de la mandibule, entre les populations natives et les populations introduites. Les individus des populations introduites présentent des crânes et des mandibules plus grands, avec des crânes plus large et courts, et des mandibules également plus courtes. Nos analyses suggèrent que ces différences pourraient s’expliquer par les changements de composition des écosystèmes entre milieux continental natif et milieu insulaire d’introduction, mais pourraient également être interprétées au regard de l’histoire de l’introduction de l’espèce.

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