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Record W4405678454

Mécanismes subcellulaires gouvernant la régulation spatiotemporelle d'événements morphogénétiques simultanés

2024· dissertation· en· W4405678454 on OpenAlexaff
Nicolas Roby

Bibliographic record

Venuetheses.fr (ABES) · 2024
Typedissertation
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicPlanarian Biology and Electrostimulation
Canadian institutionsCanadian Paediatric Society
FundersCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la Recherche
KeywordsComputer scienceCell biologyBiology
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Mécanismes subcellulaires gouvernant la régulation spatiotemporelle d'événements morphogénétiques simultanés La morphogenèse est le processus fondamental par lequel un organisme acquiert sa forme, établissant les fondations structurelles et fonctionnelles nécessaires à son développement correct. Pendant l'embryogenèse, la morphogenèse tissulaire découle du contrôle génétique des forces locales et globales pour façonner les feuillets épithéliaux en structures matures. Nous avons désormais une compréhension de la régulation génétique impliquée dans le remodelage du cytosquelette pour générer ces forces et réaliser des processus morphogénétiques simples. Cependant, ces événements ont été étudiés individuellement, alors qu'ils surviennent simultanément durant le développement. Pour explorer comment un même tissu subit plusieurs changements de forme simultanés, nous utilisons l'embryon de Drosophile comme modèle, en nous concentrant sur le repliement et l'extension simultanés du mésoderme présomptif. Cette transformation tissulaire complexe repose sur la réorganisation du réseau cortical d'actomyosine en deux niveaux subcellulaires. Le premier niveau, situé à l'apex des cellules mésodermiques, médie la constriction apicale pour le repliement du mésoderme, tandis que le second niveau, situé au cortex latéral, entraîne l'intercalation cellulaire polarisée pour la convergence-extension du tissu. Nous étudions maintenant comment les cellules mésodermiques parviennent à contrôler spatio-temporellement la distribution d'actomyosine en niveaux subcellulaires distincts pour réaliser des changements simultanés de forme et de topologie. Des travaux antérieurs ont mis en évidence le déplacement basal des noyaux pendant le repliement du mésoderme, un phénomène conservé durant l'embryogénèse de nombreuses espèces. Bien que de nombreuses recherches aient pu élucider la régulation du positionnement nucléaire, l'effet de la position du noyau sur la morphogenèse tissulaire reste inconnu. Dans cette étude, je démontre que le noyau contrôle la distribution subcellulaire du réseau d'actomyosine. En raison des contraintes géométriques imposées par la forme columnaire des cellules épithéliales du mésoderme, le noyau agit comme une barrière, protégeant le cortex latéral du réseau de microtubules et régulant la distribution de la molécule de signalisation RhoGEF2. Le repositionnement basal du noyau, entraîné par la contraction du premier niveau d'actomyosine et le flux cytoplasmique résultant, permet de libérer le cortex latéral pour que RhoGEF2 s'y accumule, dirigeant ainsi la formation stéréotypée du second niveau d'actomyosine. Ce travail identifie donc un nouveau rôle du noyau permettant la compartimentation spatio-temporelle du cytosquelette, générant ainsi une structure modulaire qui alimente plusieurs processus morphogénétiques simultanés.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow)
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.197
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.258
Teacher spread0.252 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2024
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