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Characterization of Enterococcus faecalis Isolated from Pullet Layers with Growth Depression and Amyloid Arthropathy

2025· article· en· W4409506936 on OpenAlexaff
Grayson K. Walker, M. Mitsu Suyemoto, Mike Petrik, Rocio Crespo

Bibliographic record

VenueAvian Diseases · 2025
Typearticle
Languageen
FieldMedicine
TopicMycobacterium research and diagnosis
Canadian institutionsHatch (Canada)
Fundersnot available
KeywordsEnterococcus faecalisBiologyDepression (economics)MicrobiologyBacteriaGenetics

Abstract

fetched live from OpenAlex

Caracterización de Enterococcus faecalis aislado de pollitas de reemplazo de postura con depresión del crecimiento y artropatía amiloide. Enterococcus faecalis es una bacteria comensal que coloniza el intestino de mamíferos y aves. Se caracteriza por ser un patógeno oportunista y se ha asociado comúnmente con mortalidad embrionaria en etapa tardía, onfalitis, depresión del crecimiento, sepsis y artropatía amiloide en la avicultura comercial. En este estudio, los aislamientos de E. faecalis recuperados de una parvada de 6200 pollitas de postura ubicadas en Canadá exhibieron un crecimiento deficiente, uniformidad deficiente y cojera esporádica que comenzó a la semana de edad y se extendió durante toda la fase de crianza. Enterococcus faecalis se aisló de articulaciones tarsometatarsianas inflamadas de pollitas cojas que contenían material de color amarillo anaranjado y de muestras ambientales de la caseta. Se identificaron dos tipos de secuencias conocidas por ser patógenas para los pollos, ST82 y ST49, entre los aislamientos de las articulaciones. Se detectaron diecisiete genes de virulencia conocidos de E. faecalis en estas cepas, incluido gelE para la producción de gelatinasa y el gene del péptido de señalización de detección de quórum fsrB necesario para la regulación de la virulencia. El análisis filogenético reveló que una cepa ST82 aislada de una muestra ambiental estaba relacionada clonalmente con el aislamiento de la articulación. Además, ambos tipos de secuencia, ST82 y ST49, tenían genes de resistencia a los antimicrobianos contra tetraciclinas, lincosamida y estreptograminas. ST49 tenía genes de resistencia adicionales a los ionóforos comunes utilizados en la producción avícola. Se realizó un ensayo de letalidad embrionaria para determinar la patogenicidad de los aislamientos. La inoculación con ST82 resultó en una supervivencia significativamente menor de los embriones en comparación con ST49. Hasta la fecha, se han notificado casos de artropatía amiloide causada por E. faecalis en países europeos, pero rara vez en explotaciones avícolas de América del Norte. Es necesario caracterizar mejor estas cepas de E. faecalis para dilucidar las vías de transmisión, descubrir reservorios ambientales e identificar genes de virulencia específicos en el desarrollo de la artropatía amiloide en la avicultura.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.009

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.005
GPT teacher head0.235
Teacher spread0.230 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations2
Published2025
Admission routes1
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