Élaboration de définitions fondées sur les codes de la Classification internationale des maladies pour l'étude des séquelles d'infections entériques au Canada
Bibliographic record
Abstract
Contexte : Les infections entériques et leurs séquelles chroniques sont une cause majeure d'invalidité et de décès.Malgré l'utilisation croissante des données administratives relatives à la santé pour mesurer le fardeau des maladies chroniques dans la population, il existe peu de définitions de cas validées fondées sur les codes de la Classification internationale des maladies (CIM), particulièrement dans le contexte canadien.Notre objectif était de valider les définitions des codes de la CIM pour les séquelles des infections entériques au Canada : insuffisance rénale aiguë (IRA); syndrome hémolytique et urémique (SHU); purpura thrombopénique thrombotique (PTT); syndrome de Guillain-Barré/syndrome de Miller-Fisher (SGB/SFM); polyneuropathie inflammatoire démyélinisante chronique (PIDC); spondylarthrite ankylosante (SA); arthrite réactionnelle; uvéite antérieure; maladie de Crohn, colite ulcéreuse, maladie coeliaque, érythème noueux (EN); listériose néonatale (LN) et la maladie de Graves (MG).Méthodes : Nous avons adopté une approche à plusieurs étapes en procédant à une revue de la littérature pour recenser les définitions validées existantes, à une évaluation des définitions validées par les cliniciens, à un examen des dossiers pour vérifier les définitions proposées et à un examen final par les cliniciens.Nous avons mesuré la sensibilité et la valeur prédictive positive (VPP) des définitions proposées.Résultats : Quarante études répondaient aux critères d'inclusion.Nous avons recensé des définitions validées pour 12 séquelles; les cliniciens en ont élaboré trois (EN, LN, MG).Nous avons examiné 181 dossiers pour 6 séquelles (IRA, SHU, PTT, SGB/SMF, PIDC, SA).La sensibilité (42,8 %-100 %) et la VPP (63,6 %-100 %) des définitions des codes de la CIM varient.Six définitions ont été modifiées par les cliniciens après l'examen des dossiers (IRA, PTT, SGB/SMF, PIDC, SA, arthrite réactionnelle) afin de tenir compte des pratiques de codage, d'augmenter la spécificité ou la sensibilité et de répondre aux contraintes logistiques. Conclusion :La conception en plusieurs étapes des définitions des codes de la CIM a permis de recenser les définitions existantes, d'améliorer leur sensibilité et leur VPP et de les adapter au contexte canadien.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.024 | 0.078 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.002 |
| Bibliometrics | 0.011 | 0.018 |
| Science and technology studies | 0.004 | 0.004 |
| Scholarly communication | 0.005 | 0.002 |
| Open science | 0.003 | 0.004 |
| Research integrity | 0.001 | 0.003 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.006 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".