Faire la lumière sur l’horloge circadienne de l’épinoche à trois épines
Bibliographic record
Abstract
L’horloge circadienne est un système interne présent chez presque tous les organismesvivants et permettant de coordonner les fonctions biologiques entre elles et avec l’environnement. Dans les dernières décennies, l’horloge circadienne a majoritairement été étudiée en laboratoire à l’aide d’organismes modèles. Les connaissances concernant l’importance fonctionnelle et l’évolution des rythmes circadiens en nature sont donc limitées. L’épinoche à trois épines (Gasterosteus aculeatus) montre plusieurs caractéristiques intéressantes pour étudier l’horloge circadienne du point de vue de l’écologie et de l’évolution. Toutefois, ses rythmes circadiens n’ont presque jamais été étudiés et l’existence d’une horloge circadienne n’a jamais été démontrée chez cette espèce. À l’aide d’épinoches sauvages que nous avons rapportées au laboratoire, nous avons donc étudié l’horloge circadienne de cette espèce aux niveaux comportemental et moléculaire. Notre premier objectif était de déterminer si le rythme journalier de l’activité locomotrice est contrôlé par l’horloge circadienne. En quantifiant l’activité locomotrice sous un cycle lumière-noirceur(LD) et en noirceur constante (DD), nous avons montré que les épinoches ont bel et bien une horloge circadienne, mais que l’activité est faiblement contrôlée par celle-ci. Notre deuxième objectif était de déterminer la phase de l’activité des épinoches en LD. Nos résultats indiquent qu’elles sont majoritairement nocturnes, mais nous avons aussi observé une grande variation interindividuelle. Notre troisième objectif était de décrire l’oscillation moléculaire circadienne de cinq gènes de l’horloge (bmal1a, clock1b, clock2, per1b et cry1b)dans le cerveau des épinoches en DD en utilisant la PCR quantitative en temps réel. Nous n’avons pas détecté de rythmicité circadienne dans l’expression des gènes, ce qui pourrait soit indiquer que l’oscillateur moléculaire est très dépendant de la lumière ou qu’il y avait bel et bien une oscillation, mais que nous avons été incapables de la détecter. Dans l’ensemble, notre étude permet de mieux comprendre le rôle et les mécanismes de l’horloge circadienne chez l’épinoche et ouvre la voie à une exploration plus approfondie des rythmes circadiens chez cette espèce.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.001 |
| Open science | 0.000 | 0.001 |
| Research integrity | 0.000 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.003 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".