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Record W7027641557

Derivati piridin-2-oni quali potenziali modulatori allosterici del recettore cannabinoide CB2

2021· article· it· W7027641557 on OpenAlexaboutno aff

Bibliographic record

VenueElectronic Theses and Dissertations Repository (University of Pisa) · 2021
Typearticle
Languageit
FieldComputer Science
TopicHistory of Computing Technologies
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsPillarFree accessQualitative analysis
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Il sistema endocannabinoide (ECS) è un sistema endogeno neuromodulatorio ad ampio raggio coinvolto nella regolazione di molte funzioni del corpo umano. E’ costituito dai recettori cannabinoidi CB1 e CB2, entrambi appartenenti alla famiglia dei recettori accoppiati a proteine G (GPCRs), dai ligandi endogeni noti come endocannabinoidi (ECs) di cui i principali sono l’anandamide (AEA) e il 2-arachidonoilglicerolo (2-AG), e dagli enzimi deputati alla biosintesi, al trasporto (FAAH, MAGL, ABHD6, ABHD12) ed alla degradazione (EMT) degli endocannabinoidi. Mentre il recettore CB1 è maggiormente espresso a livello del sistema nervoso centrale, il recettore CB2 è principalmente espresso nelle cellule associate al sistema immunitario, dove modula la migrazione cellulare e il rilascio di citochine, moderatamente a livello periferico e in misura minore anche nel SNC, soprattutto nella microglia. Questa ampia distribuzione dei CBR e il loro coinvolgimento in numerosi processi fisiologici ha incoraggiato negli anni la ricerca verso l’identificazione e la caratterizzazione farmacologica di ligandi ortosterici dei CBRs, come potenziali farmaci per il trattamento di diverse patologie. Nonostante queste ottime premesse ad oggi solo poche molecole di questo tipo hanno ottenuto l’approvazione normativa per determinate indicazioni in quanto presentano numerosi effetti collaterali tra cui effetti psicoattivi, ansia, depressione o immunodepressione, che hanno inevitabilmente limitato lo sviluppo clinico di nuovi potenziali farmaci. Al fine di ovviare a questi effetti collatarali, negli ultimi anni sono stati sviluppati approcci alternativi di modulazione dell’ECS, tra i quali è da annoverare la modulazione allosterica. I modulatori allosterici sono molecole capaci di legare siti topograficamente e strutturalmente distinti dal sito ortosterico, a livello del quale inducono una modificazione conformazionale che si rifletterà a sua volta sull’affinità e/o sull’efficacia del ligando ortosterico per il recettore. Infatti, essi possono essere classificati in: • Modulatori allosterici positivi (PAMs): aumentano l’attività del ligando ortosterico e/o la sua attività funzionale a livello del recettore • Modulatori allosterici negativi (NAMs): al contrario dei PAM, inibiscono l’attività del ligando ortosterico e/o la sua attività funzionale a livello del recettore • Ago-PAMs o allo-antagonists: composti capaci di espletare rispettivamente una funzione agonista o antagonista anche in assenza di ligando ortosterico • Ligandi allosterici neutrali (NALs): non influenzano la risposta dovuta al ligando ortosterico ma possono competere con un PAM o un NAM al livello del sito recettoriale. I modulatori allosterici offrono diversi vantaggi rispetto ai ligandi ortosterici: maggiore specificità per il sottotipo recettoriale (la sequenza amminoacidica a livello dei siti allosterici risulta meno conservata); selettività tissutale (l’effetto si esplica solo dove sono presenti i ligandi endogeni); saturabilità dell’effetto; “signalling” preferenziale e “probe” -dipendenza, ovvero la capacità di attivare selettivamente certe vie di segnale rispetto ad altre, anche a seconda del ligando ortosterico che interagisce con il recettore. Nel laboratorio dove ho svolto la tesi è stato sintetizzato il primo PAM del CB2R, l’EC21a. Il suo comportamento allosterico è stato evidenziato inizialmente con saggi di binding a livello del CB2R in cui è stata evidenziata un’aumentata affinità di legame da parte dell’agonista ortosterico di riferimento [3H] CP55940. Successivamente i saggi funzionali GTPγS, cAMP e beta arrestina, hanno mostrato come EC21a fosse in grado di aumentare l’attività del CP55940 e, nel caso del GTPγS, anche dell’endocannabinoide 2-AG ma non dell’AEA. Gli stessi saggi funzionali sono stati svolti anche in assenza del ligando endogeno di riferimento e l’EC21a non ha mostrato alcuna attività, risultato in linea con la sua natura di puro PAM. E’ stato infine testato anche in vivo sia in un modello murino di dolore neuropatico rivelando una promettente azione antinocicettiva, che in un modello di epilessia mostrando una importante azione anticonvulsiva. Durante il mio periodo di tesi ho sintetizzato nuovi derivati dell’EC21a (composti A in tabella) andando a modificare in particolare la posizione 4 dell’anello piridinico, per ampliare le conoscenze riguardo la struttura-attività (SAR) di questa classe di composti. Fino ad ora le uniche modifiche apportate in questa posizione sono state la sostituzione del metile con un gruppo ossidrilico o la sua eliminazione. In entrambi i casi i risultati erano stati negativi. Il mio lavoro di tesi si è quindi incentrato nel sostituire il metile con altri gruppi con differenti caratteristiche stereo-elettroniche ed in particolare il metile è stato sostituito con sostituenti aromatici, quali il fenile (A1) e il p-metossifenile (A2), un atomo di cloro (A3), e gruppi etereo (A4) ed ammino (A5) alchilici. I composti A1-A5 verranno testati presso l’Università di Saskatchewan, nel laboratorio del Dr Laprairie con opportuni saggi sia di binding che funzionali allo scopo di valutare il loro profilo allosterico.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.014
Threshold uncertainty score0.048

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.001
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0140.004

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.011
GPT teacher head0.211
Teacher spread0.200 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Published2021
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