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Record W7043031653

Rôle du gène RFC1 dans le développement du cervelet

2024· dissertation· fr· W7043031653 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2024
Typedissertation
Languagefr
FieldNeuroscience
TopicGenetic Neurodegenerative Diseases
Canadian institutionsnot available
FundersFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCourtois Foundation
KeywordsHuman physiologyGenetic inheritanceCerebellar ataxia
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Le syndrome CANVAS (Cerebellar Ataxia with Neuropathy and Vestibular Areflexia Syndrome) est une ataxie cérébelleuse rare qui apparaît à l'âge adulte, et se caractérise par des déséquilibres et une neuropathie sensorielle. Des expansions répétées introniques bialléliques dans l’intron 2 du gène RFC1 ont été identifiées comme cause du CANVAS. Le gène RFC1 code pour la plus grande sous-unité du Facteur de Réplication C, important à la réplication et la réparation de l'ADN. Alors que onze répétitions pentanucléotidiques (AAAAG)11 sont normalement retrouvées, les expansions pathogènes comprennent généralement des centaines de répétitions (AAGGG)exp. Toutefois, les mécanismes selon lesquels ces expansions répétées provoquent ce trouble neurologique sont inconnus. Des articles récents ont identifié des mutations de décalage de cadre dans RFC1, suggérant la perte de fonction comme mécanisme pathogénique. De manière intéressante, nous avons montré que rfc1 est exprimé dans le cervelet en développement chez la souris et le poisson-zèbre, ce qui indique qu'il pourrait jouer un rôle crucial dans son développement et son activité. Étant donné que l'inactivation de RFC1 chez les mammifères entraîne une létalité embryonnaire, nous avons généré un modèle de poissons-zèbres avec une perte de fonction rfc1-KO en utilisant la méthode CRISPR/Cas9. Nous avons constaté que les larves rfc1-/- survivent jusqu'à 10 jours après la fécondation (dpf) et présentent un phénotype morphologique sévère à partir de 2 dpf. Plus important encore, nous avons montré que le développement du cervelet est sévèrement affecté avec une diminution de la prolifération associée à une augmentation de l’apoptose dans le cervelet des mutants rfc1-/-, conduisant à une désorganisation des cellules de Purkinje et une perte des cellules granulaires. Grâce au séquençage de l'ARNm à cellule unique (single cell RNA sequencing, scRNAseq), nous avons démontré l'importance de rfc1 pour la neurogenèse cérébelleuse et que sa perte de fonction conduit à de graves défauts de progéniteurs. Ce travail est le premier à générer un modèle de poissons-zèbres rfc1-KO et à montrer que RFC1 est important pour le développement du cervelet, suggérant que CANVAS pourrait être causé par un mécanisme de perte de fonction de RFC1.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.003
Threshold uncertainty score0.007

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.000
Science and technology studies0.0000.001
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.010
GPT teacher head0.187
Teacher spread0.178 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2024
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