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Record W7115012381 · doi:10.71781/33971

Impact of hepatitis C virus (HCV) and direct acting antivirals (DAA) on the persistence of human immunodeficiency virus-1 (HIV) reservoirs during antiretroviral therapy (ART)

2025· dissertation· en· W7115012381 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenueOpen MIND · 2025
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicHepatitis C virus research
Canadian institutionsnot available
FundersCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsPublic Health AgencyNational Institutes of HealthInternational AIDS SocietyPublic Health Agency of CanadaCanadian Foundation for AIDS ResearchStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
KeywordsHuman immunodeficiency virus (HIV)Hepatitis C virusSidaAntiretroviral therapyHepacivirusVirus

Abstract

fetched live from OpenAlex

Le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le virus de l’hépatite C (VHC) ont provoqué deux pandémies majeures ayant profondément marqué la médecine moderne. Découvert en 1983, le VIH cible les lymphocytes T CD4+ et affaiblit le système immunitaire. Grâce au traitement antirétroviral (TAR), les personnes vivant avec le VIH peuvent mener une vie quasi normale, bien que le virus persiste sous forme de réservoirs latents, rendant la guérison impossible à ce jour. Le VHC, identifié en 1989, est un virus hépatotrope responsable d’hépatites chroniques pouvant évoluer vers la cirrhose ou le cancer du foie. Contrairement au VIH, le VHC est aujourd’hui guérissable grâce aux antiviraux à action directe (AAD), efficaces à plus de 95 %. Toutefois, la stigmatisation, le dépistage tardif et l’accès limité aux soins demeurent des obstacles majeurs, notamment chez les populations marginalisées. La co-infection VIH/VHC représente une convergence complexe de deux pathogènes à fort impact, amplifiant mutuellement leur pathogénicité. Le VHC, en exacerbant l’activation immunitaire systémique et la dysrégulation inflammatoire, pourrait favoriser l’établissement ou la persistance des réservoirs VIH malgré un TAR efficace. C’est dans ce contexte que s’inscrit mon projet de doctorat, qui vise à mieux comprendre cette interaction virale et ses implications sur les réservoirs du VIH. Dans mes travaux, j’ai émis l’hypothèse que les cellules T CD4+ spécifiques au VHC constituent une niche privilégiée pour l’infection par le VIH et la persistance virale, même après la guérison du VHC. En analysant les profils phénotypiques de ces cellules, j’ai démontré qu’elles exprimaient des marqueurs de de cellules hautement permissives à l’infection tels que CCR5, CXCR6 et CCR6. Des analyses in vitro et ex vivo ont montré que ces cellules pouvaient héberger de l’ADN viral intégré et même du virus réplicatif, confirmant leur rôle dans le maintien du réservoir du VIH. De plus, en étudiant une cohorte de patients co-infectés avant, pendant et après traitement par AAD, j’ai observé que la guérison du VHC entraînait une réduction significative du réservoir VIH chez certains participants, particulièrement ceux ayant contracté le VHC avant le VIH. Toutefois, cette réduction restait incomplète, illustrant la complexité de l’éradication du VIH, même dans un contexte immunologique allégé par la disparition du VHC. Ces résultats soulignent un paradoxe important : alors que le VHC est aujourd’hui guérissable, sa présence historique chez les PVVIH pourrait avoir laissé une empreinte durable sur l’architecture des réservoirs du VIH. Cela renforce l’idée que l’éradication du VIH nécessitera bien plus que des approches antivirales classiques. Il faudra non seulement cibler les réservoirs dans des populations cellulaires spécifiques comme les cellules T CD4+ spécifiques aux co-pathogènes, mais aussi intervenir tôt dans le cours de l’infection et dans la gestion des co-infections. Ainsi, cette recherche contribue à éclairer l’un des défis majeurs de la virologie contemporaine : comprendre les facteurs cellulaires, immunologiques et virologiques qui permettent au VIH de persister, malgré une suppression thérapeutique efficace. Elle démontre également que la guérison du VHC, bien qu’essentielle, ne suffit pas à elle seule à résoudre le problème de la latence du VIH. L’histoire du VIH et du VHC, avec leurs similitudes et leurs différences, rappelle que la lutte contre les virus ne repose pas uniquement sur des avancées pharmacologiques, mais également sur une compréhension fine de leur interaction avec le système immunitaire et leur impact à long terme.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.009

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.002
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0030.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.084
GPT teacher head0.397
Teacher spread0.313 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2025
Admission routes1
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