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Record W7161976922 · doi:10.82308/14973

Determining the risk of depressive disorder as a sequela of a foodborne infection using administrative data from British Columbia, Canada : a retrospective population-based cohort study

2022· dissertation· en· W7161976922 on OpenAlexaboutno aff
Valérie Rodrigue

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldNeuroscience
TopicTryptophan and brain disorders
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsSequelaPublic healthRetrospective cohort studyCohort study

Abstract

fetched live from OpenAlex

Contexte: Plusieurs études ont indiqué que les troubles dépressifs (TD) peuvent être une séquelle d’une infection. Malgré l’intérêt croissant envers l’axe intestin-cerveau, peu d’études ont exploré le rôle des Infections d’Origine Alimentaire (IOA) dans le développement des TD et aucune n’a évalué l’impact à long terme de pathogènes spécifiques. Des études suivant sur une longue période des patients dont le pathogène a été identifié en laboratoire sont requises pour évaluer l’impact de différentes IOA sur le risque de TD. Objectif: L’objectif de cette thèse était de déterminer si l’exposition à 14 IOA (botulisme, Campylobacter, Cryptosporidium, Cyclospora, Giardia, Hépatite A, Listéria, Salmonella spp. (non-typhoïde, Typhi, Paratyphi), Escherichia Coli producteurs de Shigatoxines (STEC), Shigella, Vibrio parahaemolyticus, et Yersinia) augmente le risque de développer un TD. Méthodes: J’ai conduit une étude de cohorte rétrospective de tous les résidents de Colombie-Britannique (CB) vivant dans la province entre le 1er janv. 2005 et le 31 déc. 2014 (env. 4.7 millions). Les cas d’IOA confirmés par laboratoire et capturés dans la base de surveillance Panorama, ont été liés avec les données de six bases administratives incluant PharmaNet, qui contient toutes les prescriptions servies en CB, sans égard au payeur. Les modèles de risques proportionnels de Cox ont été utilisés avec un appariement cas:témoins de 1:4 pour calculer les rapports de risque (RR) de l’incidence des TD ainsi que les intervalles de confiance (IC) à 95% suivant l’exposition aux 14 IOA, comparant les individus exposés à une IOA et les individus non-exposés. Les RR ont été ajustés en fonction de l’âge, le sexe, le décile de revenu, la sous-région sanitaire, les comorbidités et l’exposition aux antibiotiques, inhibiteurs de la pompe à protons, statines ainsi qu’agents immunosuppresseurs et immunomodulateurs.Résultats: 33 360 patients exposés et 133 068 patients non-exposés, appariés sur le sexe, l’âge exact et la durée de la couverture MSP ont été inclus dans cette étude. Sur un suivi moyen de 5.80 ans, 4 515 (23.7 pour 1000 pers.-années) cas incidents de TD ont été détectés chez les patients exposés et 12 273 (15.8 pour 1000 pers.-années) chez les patients non-exposés. Les patients exposés avaient 38% plus de risques de développer un TD (RR aj. 1.38 IC 95% 1.33-1.43) que les patients non-exposés. L’usage récent d’antibiotiques, un facteur de risque de TD, était plus commun dans le groupe exposé à une IOA que dans le groupe non-exposé (8.9% vs 3.2%). Après stratification en fonction de l’usage d’antibiotiques, le RR demeure significatif (RR aj. 1.14, IC95% 1.01-1.28). Le sexe et la présence d’un diagnostic de syndrome de l’intestin irritable ne sont pas des modificateurs d’effet significatifs. Lors des analyses individuelles, les pathogènes campylobacter (RR aj 1.36, IC95% 1.28-1.44), salmonella non-typhoïde (RR aj 1.40, IC95% 1.29-1.52), giardia (RR aj 1.34, IC95% 1.21-1.48), yersinia (RR aj 1.58, IC95% 1.44-1.74) and shigella (RR aj 1.55, IC95% 1.30-1.85) ont tous été associés à une hausse du risque de TD. Le pathogène STEC n’a pas été associé à un risque accru de TD (RR aj 1.15, IC95% 0.93-1.42).Discussion: Une association a été démontrée entre les IOA et le risque de TD. La bactérie yersinia est associée à un risque accru de TD par rapport aux autres pathogènes, possiblement dû à la prévalence plus élevée de conditions gastro-intestinales (GI) chez les patients atteints de yersiniose. Ces résultats sont alignés avec ceux des autres études, qui indiquent un lien entre les infections GI et le risque de troubles affectifs, bien que le lien entre le STEC et les TD décrit dans une autre étude n’a pas été observé dans cette étude. Conclusion: Au vu de son association avec les TD, la confirmation par laboratoire d’une IOA pourrait être un indicateur pour les cliniciens qu’une approche plus proactive de prévention et de détection des TD est appropriée

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.024
Threshold uncertainty score0.077

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.002
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.001
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0010.004
Science and technology studies0.0030.001
Scholarly communication0.0020.000
Open science0.0010.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.035
GPT teacher head0.312
Teacher spread0.277 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2022
Admission routes1
Has abstractyes

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