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Record W7162022491 · doi:10.82308/35948

The distribution and predictors of cyanobacteria and their toxins across a wide range of Canadian lakes

2023· dissertation· en· W7162022491 on OpenAlexaboutno aff
Paul MacKeigan

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldEnvironmental Science
TopicAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsDistribution (mathematics)Environmental factorVoltinismPrimary productivity

Abstract

fetched live from OpenAlex

Au cours des dernières décennies, l’augmentation de la fréquence et magnitude des efflorescences a été documentée dans plusieurs lacs mondiaux, ce qui a galvanisé les efforts visant à identifier les facteurs qui promouvaient la biomasse des cyanobactéries et de leur structure communautaire. Malgré l’attention aux cyanobactéries comme mesure cible de la qualité de l’eau, il n’y a pas eu de programme d’échantillonnage systématique ou d’examen complémentaire des facteurs influençant l’abondance des cyanobactéries et de leurs toxines dans les lacs à l’échelle nationale au Canada. Ma thèse de doctorat utilise un programme d’échantillonnage de lacs à grande échelle avec des centaines de lacs pour fournir un portrait global des dynamiques contemporaine des cyanobactéries à travers le Canada. Spécifiquement, elle vise à (1) quantifier les modèles spatiaux de la biomasse des cyanobactéries et à identifier leurs prédicteurs; (2) évaluer la congruence entre les méthodes traditionnelles et modernes pour générer la composition des communautés; et (3) quantifier l’abondance des cyanotoxines (microcystines) et leurs prédicteurs. Dans mon premier chapitre, j’ai démontré que la biomasse des cyanobactéries était significativement plus élevée dans le centre du Canada. J’ai démontré que malgré la prise en compte d’une gamme exhaustive de variables, les résultats corroborent avec les études antérieures identifiant les nutriments, en particulier le phosphore, comme le meilleur prédicteur de la biomasse et de la composition des communautés de cyanobactéries. Dans ce chapitre, j’ai également été en mesure d’éclairer sur une composante souvent négligée des modèles de prédiction des cyanobactéries: les variables biotiques. Plus précisément, j’ai constaté que la biomasse des daphnies et des copépodes était positivement liée à la biomasse des cyanobactéries, ce qui pourrait être dû à une variété de facteurs, notamment la libération de la prédation de zooplancton, les sources de nourriture alternatives pour le zooplancton et/ou les adaptations évolutives. Dans l’ensemble, étant donné qu’une grande matrice de prédicteurs potentiels a été prise en compte et que les meilleurs modèles ont expliqué ~50% de la variation des cyanobactéries, je pense que nous avons potentiellement maximisé le pouvoir prédictif dans l’analyse des échantillons ponctuels sur les cyanobactéries morphologiquement identifiées. Dans mon deuxième chapitre, j’ai mené une analyse comparative en utilisant deux méthodes différentes d’assignation taxonomique des communautés de cyanobactéries: la microscopie optique traditionnelle et le métabarcodage de l’ADN. En utilisant un ensemble de données sur 370 lacs, j’ai quantifié la congruence entre les communautés de cyanobactéries générées par chaque méthode taxonomique et l’accord modéré mais significatif entre les méthodes. Les deux méthodes étaient plus congruentes dans le sous-ensemble des lacs riches en nutriments, et à des niveaux plus grossiers d’assignation taxonomique. Dans l’ensemble, nous avons démontré que la microscopie et le métabarcodage de l’ADN ne donnent pas nécessairement des communautés de cyanobactéries identiques mais fournissent des informations complémentaires. Enfin, dans mon troisième chapitre, j’ai étudié la concentration, la distribution et les prédicteurs des microcystines totales et caractérisé les profils de leurs congénères spécifiques dans les lacs canadiens. Les concentrations de microcystines étaient généralement faibles par rapport aux directives réglementaires, mais plus élevées dans les lacs des Prairies et des Plaines boréales. L’une des principales conclusions de ce chapitre est qu’une variété de congénères de microcystines moins courante étaient présente dans les lacs canadiens, mais que les deux plus abondants étaient MC-LR et MC-LA. En général, l’abondance relative des congénères n’était que modérément corrélée aux variables environnementales, ce qui suggère que d’autres facteurs régulent leur production

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.019
Threshold uncertainty score0.136

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.002
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0020.004
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0020.001
Open science0.0010.001
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.207
Teacher spread0.201 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2023
Admission routes1
Has abstractyes

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