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Enregistrement W1006583568 · doi:10.47749/t/unicamp.2009.469486

Estudo funcional de variantes estruturais da hemoglobina humana

2009· dissertation· pt· W1006583568 sur OpenAlexaboutno aff
Susan E. Jorge

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Languept
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A hemoglobina (Hb), pigmento respiratorio de todos os organismos vertebrados, encontra-se em elevadas concentracoes nas hemacias e e responsavel pelo transporte de O2 dos pulmoes para os tecidos. A Hemoglobina humana constitui-se de dois pares de cadeias polipeptidicas (globinas), cada qual envolvendo um grupo prostetico heme, que se liga reversivelmente ao O2. Mais de 1000 variantes estruturais da Hb humana ja foram descritas, parte delas relacionada a manifestacoes clinicas importantes. Algumas variantes apresentam alteracao funcional, que se traduz em afinidade modificada pelo O2. Quando elevada, ha uma producao compensatoriamente maior de hemacias, levando a policitemia; quando diminuida, resulta em cianose. O Laboratorio de Hemoglobinopatias do Departamento de Patologia Clinica da FCM/UNICAMP e um dos laboratorios de referencia no pais, tendo identificado, ate o momento, 12 hemoglobinas novas e 51 variantes raras. Destas, as variantes novas Hb Hb Boa Esperanca (?16 Lys?Thr), Hb Itapira (?30 Glu?Val), Hb Bom Jesus da Lapa (?30 Glu?Ala), Hb Olinda [s22 (b4) -25 (b7)], Hb Caruaru (s 122 Phe?Ser) e Hb S-Sao Paulo (s6 Glu?Val ; s65 Lys?Glu) foram aqui caracterizadas funcionalmente, assim como as variantes raras Hb Iwata (a87 His??Arg), Hb Sunshine Seth (?94 Asp?His), Hb Deer Lodge (s2 His?Arg), Hb Deer Lodge (s2 His??Arg) + Hb S (s6 Glu??Val), Hb G-Siriraj (s7 Glu??Lys), Hb G-Siriraj (s7 Glu??Lys) e Hb C (s6 Glu??Lys) em associacao, Hb M-Saskatoon (s63 His??Tyr), Hb Redondo (s92 His? Asn), Hb Koln (s98 Val??Met), Hb Coimbra (s99 Asp??Glu) e Hb Dhonburi (s126 Val?Gli)+ Btal. O metodo analitico empregado foi descrito por Rossi-Fanelli & Antonini (1958), e analisa espectrofotometricamente o comportamento da Hb frente a conhecidas pressoes parciais de oxigenio (pO2), possibilitando a medida de afinidade (p50), da constante de Hill (n), que verifica o fenomeno de cooperatividade entre as cadeias globinicas para ligacao do O2, o efeito Bohr (que indica facilidade na ligacao Hb-O2 conforme e elevado o pH do meio), bem como a interacao com o Inositol Hexafosfato (IHP), um fosfato polianion que dificulta a ligacao entre a Hb e o O2. A excecao das Hbs Itapira e Bom Jesus da Lapa, em concentracoes reduzidas nos hemolisados, todas as demais apresentam afinidade alterada pelo oxigenio. Como complementacao ao estudo funcional, as Hbs Caruaru e Sao Paulo tambem foram submetidas a analise por dinâmica molecular, atraves dos programas VMD (Visual Molecular Dynamics), com dados inseridos nos softwares CHARMM (Chemistry at Harvard Molecular Mechanics) e NAMD (Nanoscale Molecular Dynamics). As demais variantes tiveram sua analise estrutural individualizada feita atraves da visualizacao de estruturas nativas depositadas no Protein Data Bank, para melhor compreensao da relacao entre o aminoacido substituido e a funcao proteica alterada. Deste modo, foi possivel estabelecer correlacoes entre a estrutura e a funcao e inferir sobre as manifestacoes clinicas resultantes da presenca destas heme proteinas anomalas, ilustrando-se assim a importância desses estudos para a completa caracterizacao das variantes Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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