Biofilm forming ability and exoproteomic analysis of Listeria monocytogenes
Notice bibliographique
Résumé
The eradication from the food industry environment of the foodborne pathogenic bacterium Listeria monocytogenes requires a better understanding of its biofilm state. The susceptibility of biofilms of L. monocytogenes, in pure and in co-culture with Pseudomonas aeruginosa, to commercial sanitizers was determined using the Calgary Biofilm Device (CBD). Biofilms produced at 12 oC were generally less susceptible to sanitizers than at 37 oC. In co-culture biofilms, L. monocytogenes although representing only 1% of the co-culture, was in the same order of magnitude as the one obtained when in pure culture (5.5 log CFU/cm). In addition to the CBD, three other methods to assess biofilm formation (crystal violet assay, epifluorescence microscopy observation and cell enumeration on stainless steel) were compared. A significant correlation was found between methods using stainless steel, evidence that data is dependent of the surface material. These results also allowed the selection of two good biofilm producing strains to be used for exoproteome investigation. For both strains, 16 identified exoproteins were more abundantly detected in the biofilm exoproteomes compared to the planktonic counterparts. One of these proteins was the putative cell wall binding protein, Lmo2504. The construction of a deletion mutant on its coding gene, confirmed the positive role of this protein in the biofilm forming ability of the wild type strain. This is the first report on the role of the exoproteome in biofilm formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».