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Enregistrement W1137578565 · doi:10.1183/13993003/erj.44.suppl_58.p4786

Associations between the 17q21 region and allergic rhinitis in five birth cohorts

2014· article· en· W1137578565 sur OpenAlexaff
Elaine Fuertes, Cilla Söderhäll, Nathalie Acevedo, Allan B. Becker, Michael Bräuer, Moira Chan‐Yeung, F. Nicole Dijk, Joachim Heinrich, Gerard H. Koppelman, Dirkje S. Postma, Juha Kere, Anita L. Kozyrskyj, Göran Pershagen, ANDREW J. SANDFORD, Marie Standl, Carla M. T. Tiesler, Mélanie Waldenberger, Marit Westman, Christopher Carlsten, Erik Melén

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of AlbertaUniversity of ManitobaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAsthmaSingle-nucleotide polymorphismConcomitantLocus (genetics)Linkage disequilibriumImmunologyInternal medicineGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The 17q21 locus is among the most implicated genetic risk factors for childhood asthma, and may be a shared risk locus with allergic rhinitis. Previous candidate gene studies on the 17q21 locus and allergic rhinitis are small and conflicting. Objective: In a pooled analysis of five birth cohorts (BAMSE, GINI/LISA, PIAMA, CAPPS and SAGE; N total =4623), we examined whether seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) located at 17q21 were associated with allergic rhinitis, and whether this association was modified in those also diagnosed with asthma. Methods: Allergic rhinitis was defined using a questionnaire-based report of doctor diagnosis or symptoms and a concomitant positive test for aeroallergen sensitization at ages four to 16 years (in the pooled data). Generalized estimating equation models, adjusted for age and cohort, assessed longitudinal associations between allergic rhinitis and the SNPs. We then evaluated associations for allergic rhinitis with and without concomitant asthma. Results: A significant longitudinal association between allergic rhinitis and rs7216389, previously implicated in genome-wide association studies on asthma, was observed (OR:1.17, 95%CI:[1.06, 1.29] with T as the effect allele). Four other SNPs in high linkage disequilibrium with rs7216389 and a fifth SNP were also associated. Associations appeared greatest for concomitant allergic rhinitis and asthma (1.35 [1.11, 1.63] for rs7216389:T), but were also observed for allergic rhinitis without concomitant asthma (1.12 [1.00, 1.24] for rs7216389:T). Conclusions: The results of this large study support the role of the 17q21 locus as a shared genetic susceptibility locus of allergic rhinitis and asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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