Associations between the 17q21 region and allergic rhinitis in five birth cohorts
Notice bibliographique
Résumé
Background: The 17q21 locus is among the most implicated genetic risk factors for childhood asthma, and may be a shared risk locus with allergic rhinitis. Previous candidate gene studies on the 17q21 locus and allergic rhinitis are small and conflicting. Objective: In a pooled analysis of five birth cohorts (BAMSE, GINI/LISA, PIAMA, CAPPS and SAGE; N total =4623), we examined whether seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) located at 17q21 were associated with allergic rhinitis, and whether this association was modified in those also diagnosed with asthma. Methods: Allergic rhinitis was defined using a questionnaire-based report of doctor diagnosis or symptoms and a concomitant positive test for aeroallergen sensitization at ages four to 16 years (in the pooled data). Generalized estimating equation models, adjusted for age and cohort, assessed longitudinal associations between allergic rhinitis and the SNPs. We then evaluated associations for allergic rhinitis with and without concomitant asthma. Results: A significant longitudinal association between allergic rhinitis and rs7216389, previously implicated in genome-wide association studies on asthma, was observed (OR:1.17, 95%CI:[1.06, 1.29] with T as the effect allele). Four other SNPs in high linkage disequilibrium with rs7216389 and a fifth SNP were also associated. Associations appeared greatest for concomitant allergic rhinitis and asthma (1.35 [1.11, 1.63] for rs7216389:T), but were also observed for allergic rhinitis without concomitant asthma (1.12 [1.00, 1.24] for rs7216389:T). Conclusions: The results of this large study support the role of the 17q21 locus as a shared genetic susceptibility locus of allergic rhinitis and asthma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».