Epigenetic Regulation of RGS2 in Cystic Fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
Cystic fibrosis (CF) is a recessive autosomal disease that affects the respiratory, gastrointestinal and reproductive systems. At pulmonary level, the absence of CFTR function (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator encoding an ion channel chlorine) leads to a decrease in mucociliary clearance, resulting in mucus accumulation. A new approach based on epigenetic regulation of gene expression has been investigated and we identified a list of hypermethylated genes in dF508 cell lines, the most frequently observed mutation in the CF population. Among the CF hypermethylated genes, RGS2 (Regulator of G protein signaling 2) gene demonstrated either transcript or protein downregulation. RGS2 is a key modulator of bronchial hyperresponsiveness, plays a critical role in fibrosis‐related diseases and inflammation. We hypothesized that variation in RGS2 protein expression could be the result of modulation of promoter methylation and has an impact on cytokine regulation. The first objective was to verify that methylation observed on RGS2 promoter in dF508 homozygous cell lines induces a modulation of protein expression. Then, to assess the consequences of this downregulation of RGS2, we performed an shRNA‐mediated RGS2 knockdown followed by DMNQ treatment in non‐CF cells and monitored the expression of inflammatory mediators. We confirmed that methylation of RGS2 promoter has an impact on RGS2 gene expression using azacythidine and oxidative stress treatments and that RGS2 is downregulated at the protein level in CF cells and in dF508 homozygous patients. We observed a relation between RGS2 downregulation by shRNA and the upregulation of 3 modulators of early inflammation: CHI3L1, S100A12 and TNFa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».