Origin, Evolution, and Extinction of Asexual Fungi: Experimental Tests Using<i>Cryptococcus neoformans</i>
Notice bibliographique
Résumé
This chapter reviews and discusses recent experimental studies using the model basidiomycetous yeast Cryptococcus neoformans to test the effects of spontaneous mutations and biological interactions that may have contributed to the distribution of asexual fungal strains and species in nature. To begin with, the author first introduces some background information on fungal sexuality and spontaneous mutations. The study of fungal sexuality could be traced back to over 100 years ago when Blakeslee discovered obligatory cross-fertilization in the Mucorales. At the population level, evidence for clonality and asexual reproduction has been found in many groups of microorganisms, including both sexual and asexual fungi. Spontaneous mutation is the ultimate source of all heritable variations in all organisms. It can occur in both replicating and nonreplicating genetic materials in cells or viral particles. The genome-wide mutation rate and the average effect per mutation are most commonly estimated using mutation accumulation (MA) experiments. In these experiments, spontaneous mutations are allowed to accumulate in replicate lines in the absence of selection for the trait under investigation. Sexuality in fungi is typically considered a qualitative trait. Two strains are considered either capable or not capable of mating with each other to produce meiotic progeny. The chapter summarizes three recent studies that tested the three hypotheses on fungal asexuality: the loss of sex, the cost of sex, and the fitness consequences of fungal asexual clones in experimental populations of C. neoformans
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».