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Enregistrement W1193091473 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a495

An antibody to the C‐terminus extension of cox2 in the male transmitted mitochondrial genome of Venustaconcha ellipsiformis (Bivalvia: Unionoidea)

2006· article· en· W1193091473 sur OpenAlexaff
Rumela Chakrabarti, Jennifer M. Walker, Donald T. Stewart, Richard J. Trdan, Srinivasan Vijayaraghavan, Jason P. Curole, Randy W Hoeh

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Invertebrate Ecology and Behavior
Établissements canadiensAcadia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNABiologyMantle (geology)GenomeImmunohistochemistryMitochondrionAntibodyGeneMolecular biologyBlotBivalviaMolluscaGeneticsZoologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Doubly uniparental inheritance of mitochondrial DNA (DUI) has been observed in two orders of marine bivalves and in the freshwater bivalve superfamily Unionoidea. Cox2 is an inner mitochondrial membrane protein that functions in complex IV of the electron transport system. PCR amplification of the cox2 ‐ cox1 junction region from unionoidean male‐transmitted (M) mtDNA genomes reveals an approximately 555 bp 3′ coding extension to cox2 . The fixed presence of the cox2 3′ extension in unionoidean M genomes may be associated with the high stability of DUI in this taxon. We made an antibody against the M cox2 C‐terminus extension from V. ellipsiformis . The antibody was characterized by blotting procedures using both soluble and insoluble extracts of testes. Attempts at detecting the lengthened cox2 protein were made using both male and female tissues and it was observed that the protein was predominantly expressed in testes. Weak expression was detected in other male tissues such as foot, mantle and gill. However, female tissues showed no immunoreactive band. Immunohistochemistry also verified that the expression of this protein is predominantly in male spermatogenic tissue. This is the first report documenting the expression of a significantly lengthened cox2 protein in the Unionoidea. We hypothesize that the expression of a lengthened cox2 protein in unionoidean bivalve testes has functional significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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