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Enregistrement W1201348515 · doi:10.1021/acs.inorgchem.5b01162

Model Peptide Studies Reveal a Mixed Histidine-Methionine Cu(I) Binding Site at the N-Terminus of Human Copper Transporter 1

2015· article· en· W1201348515 sur OpenAlexaff
M. Jake Pushie, Katharine Shaw, Katherine J. Franz, Jason Shearer, Kathryn L. Haas

Notice bibliographique

RevueInorganic Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Center for Research ResourcesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringLilly Endowment
Mots-clésChemistryPeptideCopperBinding siteHistidinePeptide sequenceActive siteCofactorRedoxX-ray absorption spectroscopyStereochemistryAmino acidCrystallographyBiochemistryEnzymeInorganic chemistryAbsorption spectroscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Copper is a vital metal cofactor in enzymes that are essential to myriad biological processes. Cellular acquisition of copper is primarily accomplished through the Ctr family of plasma membrane copper transport proteins. Model peptide studies indicate that the human Ctr1 N-terminus binds to Cu(II) with high affinity through an amino terminal Cu(II), Ni(II) (ATCUN) binding site. Unlike typical ATCUN-type peptides, the Ctr1 peptide facilitates the ascorbate-dependent reduction of Cu(II) bound in its ATCUN site by virtue of an adjacent HH (bis-His) sequence in the peptide. It is likely that the Cu(I) coordination environment influences the redox behavior of Cu bound to this peptide; however, the identity and coordination geometry of the Cu(I) site has not been elucidated from previous work. Here, we show data from NMR, XAS, and structural modeling that sheds light on the identity of the Cu(I) binding site of a Ctr1 model peptide. The Cu(I) site includes the same bis-His site identified in previous work to facilitate ascorbate-dependent Cu(II) reduction. The data presented here are consistent with a rational mechanism by which Ctr1 provides coordination environments that facilitate Cu(II) reduction prior to Cu(I) transport.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,976

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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