The interactomics of sortilin: an ancient lysosomal receptor evolving new functions.
Notice bibliographique
Résumé
The delivery of soluble lysosomal proteins to the lysosomes is dependent primarily on the mannose 6-phosphate receptor (MPR). The MPR has been demonstrated to attain the early endosomes via a process that requires the interaction of its cytosolic domain with the GGA and AP-1 adaptor proteins. Additionally, the MPR can be recycled back to the trans-Golgi network (TGN) through its interaction with the retromer complex. Interestingly, in I-cell disease (ICD), in which the MPR pathway is non-functional, many soluble lysosomal proteins continue to traffic to the lysosomes. This observation led to the discovery that sortilin is responsible for the MPR-independent targeting of the sphingolipid activator proteins (SAPs) and acid sphingomyelinase (ASM). More recently, our laboratory has tested the hypothesis that sortilin is also capable of sorting a variety of cathepsins that exhibit varying degrees of MPR-independent transport. We have demonstrated that the transport of cathepsin D is partially dependent upon sortilin, that cathepsin H requires sortilin, and that cathepsins K and L attain the lysosomes in a sortilin-independent fashion. As a type-1 receptor, sortilin also has numerous cytosolic binding partners. It has been observed that like the MPR, the anterograde trafficking of sortilin and its cargo require both GGAs and AP-1. Similarly, the retrograde recycling pathway of sortilin also involves an interaction with retromer through a YXXphi site in the cytosolic tail of sortilin. In conclusion, the cytosolic domains of sortilin and MPR possess a high degree of functional homology and both receptors share a conserved trafficking mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».