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Enregistrement W136241094 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.594.3

CGI‐58 regulates triacylglycerol metabolism and lipid signaling pathways in plant cells

2012· article· en· W136241094 sur OpenAlexaff
Sunjung Park, Satinder K. Gidda, Nicholas Khuu, Patrick J. Horn, Chris James, Kent D. Chapman, Robert T. Mullen, John M. Dyer

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPerilipinAdipose triglyceride lipaseLipid dropletLipid metabolismArabidopsisBiochemistryCell biologyChemistryBiologyLipaseGeneEnzymeAdipose tissueLipolysisMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CGI‐58 (Comparative Gene Identification‐58) encodes an α/β hydrolase‐type protein that is involved in multiple aspects of lipid metabolism in mammals, including the breakdown of triacylglycerols (TAGs) and formation of the hydrophobic barrier of the skin. Mutations in CGI‐58 result not only in aberrant skin formation, but also in accumulation of lipid droplets (LDs) in non‐lipid‐storing tissues such as skin, liver, and blood cells. The activity of CGI‐58 is determined at least in part by its interaction with other proteins including perilipin, which serves to anchor CGI‐58 to the surface of LDs. Phosphorylation of perilipin releases CGI‐58 and allows it to interact with Adipose Triglyceride Lipase (ATGL), thereby stimulating TAG breakdown. Interestingly, disruption of the CGI‐58 homolog in Arabidopsis results also in the accumulation of LDs in tissues that do not normally store lipids (e.g., leaves and stems), but plants lack any apparent homologs to perilipin or ATGL. In an effort to better understand the function of CGI‐58 in plants, we conducted a yeast 2‐hybrid assay using Arabidopsis CGI‐58 as bait. Although we did not identify any obvious LD‐associated proteins or lipases, we did identify several proteins known to be involved in distinct aspects of plant lipid metabolism. Evidence will be presented showing that CGI‐58 modulates the level of linolenic acid as well as lipid signaling pathways in plant cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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