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Enregistrement W141600936 · doi:10.1096/fasebj.21.6.a795-c

The proximal segments of the cytosolic C1 domain of adenylyl cyclase 6 localize to plasma membrane lipid rafts and caveolae

2007· article· en· W141600936 sur OpenAlexaff
Muthusamy Thangavel, Xiaoqiu Liu, Rennolds S. Ostrom

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCaveolin-1 and cellular processes
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaveolaeLipid raftCell biologyCaveolinImmunoprecipitationSphingolipidCytosolTransfectionChemistryBiologyBiochemistrySignal transductionEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipid rafts, rich in cholesterol and sphingolipids, display a high concentration of signaling proteins such as receptors, G‐proteins, and effectors molecules including certain isoforms of adenylyl cyclases (AC). The mechanism by which AC6 is localized to lipid rafts or caveolae is unknown, but previous work indicates a role for the C1 domain. In this study, we constructed recombinant proteins that comprise the four segments of the C1 domain of human AC6. The proteins correspond to amino acids 306–387, 388–490, 491–589 and 590–692 of human AC6. We transfected each protein in cos‐7 cells, which express caveolin‐1, and assessed their localization via a fused GFP. Lipid rafts and caveolae were isolated from plasma membrane using a detergent‐based fractionation method and fractions were analyzed by immunoblotting. We also used co‐immunoprecipitation and immunoflurescence microscopy to identify the subcellular targeting to each expressed C1 domain fragment. We found that only proteins 306 and 388 were associated with lipid rafts, suggesting that these portions of AC6 play a role in its localization. Thus, certain structural elements responsible for AC6 localization in lipid rafts and caveolae appear to be contained in the proximal portion of the C1 domain. Supported AHA grant 0555291B.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,281

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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