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Enregistrement W14206226

Characterization and mutation of soybean MYB transcription factor GmMYBZ2 and its prokaryotic expression.

2009· article· en· W14206226 sur OpenAlexaff
Du Hai, Lei Liu, Tang Xiao-Feng, Yanli Zhao, Jie Gao, Yanmin Wu, Huang Yu-bi, Yixiong Tang

Notice bibliographique

RevueBiochemische Zeitschrift · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZinc fingerGeneGeneticsConserved sequenceIntronMYBSaccharomyces cerevisiaeMolecular biologyExpression vectorEscherichia coliPeptide sequenceGene expressionTranscription factorRecombinant DNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soybean (Glycine max) GmMYBZ2 is one of typical plant R2R3-MYB family genes. In this study, its protein characterization and transcriptional activity were analyzed by DNAMAN and yeast (Saccharomyces cerevisiae) one-hybrid system, respectively. Moreover, the prokaryotic expression vector was constructed and expressed in Escherichia coli as well. Results showed that GmMYBZ2 not only exhibited typical features of the R2R3-MYB transcription factors, but also had a conserved amino acid motif and a predicted zinc finger region at its C-termini. Genomic DNA sequence analysis showed that it contained an intron in the R3 domain which was located at 263~395 bp. In order to investigate the infections of these motifs in GmMYBZ2’s transcriptional activity, the conserved motif and zinc finger region were detected by PCR. The effect of the altered proteins were monitored using yeast one-hybridize, which showed that GmMYBZ2 had transcriptional activation function. And the intron, conserved motif and zinc finger region might repress the transcriptional activity of GmMYBZ2. Moreover, the encoding sequence of GmMYBZ2 gene was inserted into pET30a to construct prokaryotic expression vector pET-ZD2 which was then transformed into E. coli BL21 (DE3) pLysS and Rosetta2 (DE3) pLysS, respectively. Results showed that GmMYBZ2 could be expressed in E. coli Rosetta2 (DE3) which contained complementary rare codons successfully.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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