The 5′ Binding MID Domain of Human Argonaute2 Tolerates Chemically Modified Nucleotide Analogues
Notice bibliographique
Résumé
Small interfering RNAs (siRNAs) can trigger potent gene silencing through the RNA interference (RNAi) pathway. The RNA-induced silencing complex (RISC) is key to this targeted mRNA degradation, and the human Argonaute2 (hAGO2) endonuclease component of RISC is responsible for the actual mRNA cleavage event. During RNAi, hAGO2 becomes loaded with the siRNA guide strand, making several key nucleic acid-enzyme interactions. Chemically modified siRNAs are now widely used in place of natural double-stranded RNAs, and understanding the effects chemical modifications have on guide strand-hAGO2 interactions has become particularly important. Here, interactions between the 5' nucleotide binding domain of hAGO2, MID, and chemically modified nucleotide analogues are investigated. Measured dissociation constants reveal that hAGO2 does not discriminate between nucleotide analogues during binding, regardless of the preferred sugar conformation of the nucleotide analogues. These results correlate well with cell-based gene silencing results employing siRNAs with 5'-modified guide strands. Additionally, chemical modification with 2'-deoxy-2'-fluoroarabino nucleic acid (2'F-ANA) and 2'-deoxy-2'-fluororibonucleic acid (2'F-RNA) at the passenger strand cleavage site of siRNAs has been shown to prevent hAGO2-mediated strand cleavage, an observation that appears to have little impact on overall gene silencing potency.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».