Characterisation of two wheat enolase <scp>cDNA</scp> showing distinct patterns of expression in leaf and crown tissues of plants exposed to low temperature
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Seasonal low temperature ( LT ) adversely affects growth of plants. The onset of LT in temperate zones also entails the process of cold acclimation, preparing the plants to withstand freezing temperatures. During this process of cold acclimation a number of physiological, biochemical and molecular changes occur. A differentially expressed enolase gene in wheat plants exposed to LT was previously identified by cDNA ‐amplified fragment length polymorphism. In this study, two wheat enolase cDNA , TaENO ‐a and TaENO ‐b amplified by 5′,3′ rapid amplification of cDNA end ( RACE )‐ PCR (polymerase chain reaction), were isolated and characterised. Quantitative real‐time PCR ( QPCR ) was done to assess their expression patterns in leaf and crown tissues of wheat plants exposed to LT . BLAST searches and bioinformatic analyses were done to determine the structure, domains and phylogeny of the cloned sequences. The two cDNA sequences differed mostly in the 5′ and 3′ untranslated regions. Deduced amino acid sequence showed high identity to bacteria, yeast, fungi, human and plant enolases with conserved putative DNA ‐binding and repressor domains. A genomic clone containing 17 exons distributed over 4.5 kb structurally shared a high degree of similarity to rice enolase. QPCR revealed combined effects of LT and ageing on expression of TaENO ‐a and TaENO ‐b . Down‐regulation of TaENO ‐a was observed with age in the crown tissues upon exposure to LT , but in leaf initial up‐regulation was followed by down‐regulation. Expression of TaENO ‐b was similar to expression patterns previously reported for cold‐regulated ( COR ) genes in wheat, wherein the recessive vrnA ‐1 allele influenced its expression in the leaf and genetic background determines its expression in the crown.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».