MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1480596487 · doi:10.1111/aab.12019

Characterisation of two wheat enolase <scp>cDNA</scp> showing distinct patterns of expression in leaf and crown tissues of plants exposed to low temperature

2013· article· en· W1480596487 sur OpenAlexafffund
Pallavi Sharma, S. Ganeshan, Brian Fowler, Ravindra N. Chibbar

Notice bibliographique

RevueAnnals of Applied Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesGenome Canada
Mots-clésBiologyComplementary DNAEnolaseRapid amplification of cDNA endsGeneMolecular biologyGene expressionGeneticsMolecular cloning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Seasonal low temperature ( LT ) adversely affects growth of plants. The onset of LT in temperate zones also entails the process of cold acclimation, preparing the plants to withstand freezing temperatures. During this process of cold acclimation a number of physiological, biochemical and molecular changes occur. A differentially expressed enolase gene in wheat plants exposed to LT was previously identified by cDNA ‐amplified fragment length polymorphism. In this study, two wheat enolase cDNA , TaENO ‐a and TaENO ‐b amplified by 5′,3′ rapid amplification of cDNA end ( RACE )‐ PCR (polymerase chain reaction), were isolated and characterised. Quantitative real‐time PCR ( QPCR ) was done to assess their expression patterns in leaf and crown tissues of wheat plants exposed to LT . BLAST searches and bioinformatic analyses were done to determine the structure, domains and phylogeny of the cloned sequences. The two cDNA sequences differed mostly in the 5′ and 3′ untranslated regions. Deduced amino acid sequence showed high identity to bacteria, yeast, fungi, human and plant enolases with conserved putative DNA ‐binding and repressor domains. A genomic clone containing 17 exons distributed over 4.5 kb structurally shared a high degree of similarity to rice enolase. QPCR revealed combined effects of LT and ageing on expression of TaENO ‐a and TaENO ‐b . Down‐regulation of TaENO ‐a was observed with age in the crown tissues upon exposure to LT , but in leaf initial up‐regulation was followed by down‐regulation. Expression of TaENO ‐b was similar to expression patterns previously reported for cold‐regulated ( COR ) genes in wheat, wherein the recessive vrnA ‐1 allele influenced its expression in the leaf and genetic background determines its expression in the crown.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,370
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of Applied BiologyMême sujetPlant Stress Responses and ToleranceTravaux en français237 207