MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1483689959 · doi:10.2135/cropsci2007.06.0318

Simulation‐Based Analysis of Effects of <i>Vrn</i> and <i>Ppd</i> Loci on Flowering in Wheat

2008· article· en· W1483689959 sur OpenAlexaff
Jeffrey W. White, Markus Herndl, L. A. Hunt, Thomas Payne, Gerrit Hoogenboom

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftUnited States Agency for International Development
Mots-clésVernalizationCultivarBiologyPhenologyphotoperiodismWinter wheatAgronomyBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cereal production is strongly influenced by flowering date. Wheat (Triticum aestivum L.) models simulate days to flower by assuming that development is modified by vernalization and photoperiodism. Cultivar differences are parameterized by vernalization requirement, photoperiod sensitivity, and earliness per se. The parameters are usually estimated by comparing simulations with field observations but appear estimable from genetic information. For wheat, the Vrn and Ppd loci, which affect vernalization and photoperiodism, were logical candidates for estimating parameters in the model CSM‐Cropsim‐CERES. Two parameters were estimated conventionally and then re‐estimated with linear effects of Vrn and Ppd Flowering data were obtained for 29 cultivars from international nurseries and divided into calibration (14 locations) and evaluation (34 locations) sets. Simulations with a generic cultivar explained 95% of variation in flowering for calibration data (10 d RMSE) and 89% for evaluation data (10 d RMSE), indicating the large effect of environment. Nonetheless, for the calibration data, the gene‐based model explained 29% of remaining variation, and the conventional model, 54%. For the evaluation data, the gene‐based model explained 17% of remaining variation, and the conventional model, 27%. Gene‐based prediction of wheat phenology appears feasible, but more extensive genetic characterization of cultivars is needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCrop ScienceMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207