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Enregistrement W1489315571 · doi:10.1111/mmi.12011

<scp>H</scp>fq‐dependent, co‐ordinate control of cyclic diguanylate synthesis and catabolism in the plague pathogen <i><scp>Y</scp>ersinia pestis</i>

2012· article· en· W1489315571 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYersinia bacterium, plague, ectoparasites research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNetworks of Centres of Excellence of CanadaNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesNorthwestern University
Mots-clésBiologyBiofilmMessenger RNACell biologyRNAPathogenMicrobiologyBiochemistryGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yersinia pestis, the cause of the disease plague, forms biofilms to enhance flea-to-mammal transmission. Biofilm formation is dependent on exopolysaccharide synthesis and is controlled by the intracellular levels of the second messenger molecule cyclic diguanylate (c-di-GMP), but the mechanisms by which Y. pestis regulates c-di-GMP synthesis and turnover are not fully understood. Here we show that the small RNA chaperone Hfq contributes to the regulation of c-di-GMP levels and biofilm formation by modulating the abundance of both the c-di-GMP phosphodiesterase HmsP and the diguanylate cyclase HmsT. To do so, Hfq co-ordinately promotes hmsP mRNA accumulation while simultaneously decreasing the stability of the hmsT transcript. Hfq-dependent regulation of HmsP occurs at the transcriptional level while the regulation of HmsT is post-transcriptional and is localized to the 5' untranslated region/proximal coding sequence of the hmsT transcript. Decoupling HmsP from Hfq-based regulation is sufficient to overcome the effects of Δhfq on c-di-GMP and biofilm formation. We propose that Y. pestis utilizes Hfq to link c-di-GMP levels to environmental conditions and that the disregulation of c-di-GMP turnover in the absence of Hfq may contribute to the severe attenuation of Y. pestis lacking this RNA chaperone in animal models of plague.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle