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Enregistrement W1491798713 · doi:10.3920/978-90-8686-760-8_35

Nucleotide sequence polymorphism of the growth hormone gene in American mink (Neovison vison)

2012· book-chapter· en· W1491798713 sur OpenAlexaboutno aff
Jakub Skorupski, M. Kmieć

Notice bibliographique

RevueWageningen Academic Publishers eBooks · 2012
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMinkAmerican minkBiologyGeneticsPolymorphism (computer science)Single-nucleotide polymorphismGeneGrowth hormoneGenotypeHormoneEndocrinologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nucleotide sequence variation of the American mink (Neovison vison) growth hormone gene was analysed. For this purpose 1,113 bp region of the mink genomic DNA, encompassing four exons and three introns of somatotmropin gene, was amplified by nested-PCR and sequenced. The study included 116 individuals of wild mink (Nova Scotia, Canada), ranch mink (Scanblack, Wild, Sapphire, Pearl, Black Cross and Sapphire Cross; West Pomerania, Poland) and feral mink (Poland and Iceland). Sequencing allowed to determine the nucleotide composition of previously unrecognized non-coding regions, as well as exons and to identify 12 new SNP substitutions, one single nucleotide deletion and one ins/del polymorphism. The average incidence of SNPs in coding sequences was equal to 1/156.6 bp and in non-coding – 1/86.9 bp. Analysis of the observed number and location of substitutions revealed its non-random distribution and significant preponderance of transitions over transversions. The results also revealed a significant differences between originally wild mink and domesticated animals (both ranch and feral) in identified SNPs type and distribution. The results of the present study, supported by further analysis, can help in effective genetic monitoring of feral mink, as some differences were also found between ranch and feral mink.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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