Nucleotide sequence polymorphism of the growth hormone gene in American mink (Neovison vison)
Notice bibliographique
Résumé
The nucleotide sequence variation of the American mink (Neovison vison) growth hormone gene was analysed. For this purpose 1,113 bp region of the mink genomic DNA, encompassing four exons and three introns of somatotmropin gene, was amplified by nested-PCR and sequenced. The study included 116 individuals of wild mink (Nova Scotia, Canada), ranch mink (Scanblack, Wild, Sapphire, Pearl, Black Cross and Sapphire Cross; West Pomerania, Poland) and feral mink (Poland and Iceland). Sequencing allowed to determine the nucleotide composition of previously unrecognized non-coding regions, as well as exons and to identify 12 new SNP substitutions, one single nucleotide deletion and one ins/del polymorphism. The average incidence of SNPs in coding sequences was equal to 1/156.6 bp and in non-coding – 1/86.9 bp. Analysis of the observed number and location of substitutions revealed its non-random distribution and significant preponderance of transitions over transversions. The results also revealed a significant differences between originally wild mink and domesticated animals (both ranch and feral) in identified SNPs type and distribution. The results of the present study, supported by further analysis, can help in effective genetic monitoring of feral mink, as some differences were also found between ranch and feral mink.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».