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Enregistrement W1495070809

An analysis of human cytomegalovirus gene usage A

2012· dissertation· en· W1495070809 sur OpenAlex
Sepher Seirafian

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueORCA Online Research @Cardiff (Cardiff University) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityMedical Research CouncilDirectorate for Biological SciencesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity of GlasgowBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésHuman cytomegalovirusGeneBiologyMerlin (protein)EpitopeMolecular biologyContext (archaeology)Western blotMutantVirologyGeneticsAntibody
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HCMV encodes a plethora of immune-modulating functions, many of which have yet to
\nbe assigned to specific genes. In prospect of performing high-throughput screens to
\nidentify and characterise such functions, a library of recombinant adenoviruses (RAds)
\neach encoding a V5 epitope-tagged HCMV protein was generated. Protein expression
\nwas validated and characterised for the vast majority of RAds by western blot and
\nimmunofluorescence.
\nHCMV has been reported to both upregulate cell surface expression of Fas, and render
\ncells resistant to Fas-mediated killing. This thesis demonstrated that Fas levels are
\nmarkedly reduced at the surface of HCMV-infected cells as an early function that
\npersists through the late phase. Screening a panel of HCMV deletion mutants
\neliminated 83 genes as not required for Fas downregulation, while screening the RAd
\nlibrary did not identify any single HCMV gene as being sufficient for this function.
\nDeep sequencing of the HCMV transcriptome recently led to the identification of
\nUL150A as a novel protein-coding gene. To test this prediction, UL150A was tagged
\nwithin the strain Merlin genome. UL150A was shown to encode multiple protein
\nproducts, and be expressed with early and late kinetics.
\nIn a screen of the RAd library, gpUL4 was observed to be secreted from cells. To
\ninvestigate this function in the context of HCMV infection, an epitope-tag was inserted
\nat the 3’-end of the UL4 gene in the strain Merlin genome. Tagged gpUL4 was secreted
\nfrom cells infected with strain Merlin. Secreted gpUL4 was more heavily glycosylated,
\nand produced in greater abundance than its intracellular counterpart late in infection.
\nActive secretion would be consistent with gpUL4 acting as a virokine, cytokine or
\ncytokine/chemokine-binding protein. gpUL4 purified from supernatants of Merlin- or
\nRAd-UL4-infected cells inhibited NK cell degranulation. Furthermore, gpUL4 did not copurify
\nwith virus particles, indicating it is unlikely to be a virion component.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Bibliométrie, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,747
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0130,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle