Notice bibliographique
Résumé
HCMV encodes a plethora of immune-modulating functions, many of which have yet to \nbe assigned to specific genes. In prospect of performing high-throughput screens to \nidentify and characterise such functions, a library of recombinant adenoviruses (RAds) \neach encoding a V5 epitope-tagged HCMV protein was generated. Protein expression \nwas validated and characterised for the vast majority of RAds by western blot and \nimmunofluorescence. \nHCMV has been reported to both upregulate cell surface expression of Fas, and render \ncells resistant to Fas-mediated killing. This thesis demonstrated that Fas levels are \nmarkedly reduced at the surface of HCMV-infected cells as an early function that \npersists through the late phase. Screening a panel of HCMV deletion mutants \neliminated 83 genes as not required for Fas downregulation, while screening the RAd \nlibrary did not identify any single HCMV gene as being sufficient for this function. \nDeep sequencing of the HCMV transcriptome recently led to the identification of \nUL150A as a novel protein-coding gene. To test this prediction, UL150A was tagged \nwithin the strain Merlin genome. UL150A was shown to encode multiple protein \nproducts, and be expressed with early and late kinetics. \nIn a screen of the RAd library, gpUL4 was observed to be secreted from cells. To \ninvestigate this function in the context of HCMV infection, an epitope-tag was inserted \nat the 3’-end of the UL4 gene in the strain Merlin genome. Tagged gpUL4 was secreted \nfrom cells infected with strain Merlin. Secreted gpUL4 was more heavily glycosylated, \nand produced in greater abundance than its intracellular counterpart late in infection. \nActive secretion would be consistent with gpUL4 acting as a virokine, cytokine or \ncytokine/chemokine-binding protein. gpUL4 purified from supernatants of Merlin- or \nRAd-UL4-infected cells inhibited NK cell degranulation. Furthermore, gpUL4 did not copurify \nwith virus particles, indicating it is unlikely to be a virion component.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».