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Enregistrement W1497269238 · doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05121.x

Activation of the<i>Torpedo</i>nicotinic acetylcholine receptor

2006· article· en· W1497269238 sur OpenAlexaff
Ankur Kapur, Martin Davies, William F. Dryden, Susan M. J. Dunn

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTorpedoAcetylcholine receptorNicotinic acetylcholine receptorReceptorAlpha-4 beta-2 nicotinic receptorNicotinic agonistChemistryCys-loop receptorsAcetylcholineGanglion type nicotinic receptorBiophysicsBinding siteStereochemistryBiochemistryBiologyPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Torpedo nicotinic acetylcholine receptor is a heteropentamer (alpha2betagammadelta) in which structurally homologous subunits assemble to form a central ion pore. Viewed from the synaptic cleft, the likely arrangement of these subunits is alpha-gamma-alpha-delta-beta lying in an anticlockwise orientation. High affinity binding sites for agonists and competitive antagonists have been localized to the alpha-gamma and alpha-delta subunit interfaces. We investigated the involvement of amino acids lying at an adjacent interface (gamma-alpha) in receptor properties. Recombinant Torpedo receptors, expressed in Xenopus oocytes, were used to investigate the consequences of mutating alphaArg55 and gammaGlu93, residues that are conserved in most species of the peripheral nicotinic receptors. Based on homology modeling, these residues are predicted to lie in close proximity to one another and it has been suggested that they may form a salt bridge in the receptor's three-dimensional structure (Sine et al. 2002 J Biol Chem277, 29 210-29 223). Although substitution of alphaR55 by phenylalanine or tryptophan resulted in approximately a six-fold increase in the EC50 value for acetylcholine activation, the charge reversal mutation (alphaR55E) had no significant effect. In contrast, the replacement of gammaE93 by an arginine conferred an eight-fold increase in the potency for acetylcholine-induced receptor activation. In the receptor carrying the double mutations, alphaR55E-gammaE93R or alphaR55F-gammaE93R, the potency for acetylcholine activation was partially restored to that of the wild-type. The results suggest that, although individually these residues influence receptor activation, direct interactions between them are unlikely to play a major role in the stabilization of different conformational states of the receptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,479

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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