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Enregistrement W1497306473 · doi:10.1128/9781555815776.ch13

Molecular Basis of Fungal Adherence to Endothelial and Epithelial Cells

2014· book-chapter· en· W1497306473 sur OpenAlexaff
Scott G. Filler, Donald C. Sheppard, John E. Edwards

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBasis (linear algebra)BiologyMicrobiologyComputational biologyCell biologyChemistryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter focuses on fungal adhesins that have been characterized at the genetic level and that mediate adherence to host constituents. These adhesins include Als proteins, Hwp1p, Eap1p, Csh1p, and other less well characterized proteins. ALS1 is part of a gene family that is characterized by the presence of conserved tandem repeats. The ALS gene family contains at least eight members, ALS1, ALS2, ALS3, ALS4, ALS5, ALS6, ALS7, and ALS9. A comprehensive study of the binding specificity of Als proteins expressed in Saccharomyces cerevisiae found that that Als1p, Als3p, and Als5p mediate adherence to a broad variety of host substrates, including endothelial cells, oral epithelial cells, collagen, fibronectin, and laminin. Fragments of genes with homology to the Candida albicans ALS gene family have been detected in Candida dubliniensis and Candida tropicalis. Several studies have demonstrated that Aspergillus fumigatus conidia and hyphae adhere specifically to a variety of host substrates including laminin, fibrinogen, fibronectin, and pulmonary epithelial cells. The identification and characterization of fungal adhesins have been greatly facilitated by the development of powerful molecular biology tools and the recently completed fungal genome-sequencing projects. Furthermore, many important fungal adhesins will probably be glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked proteins with serine- and threonine-rich tandem repeats in their central domains. Identification of these adhesins is important because it provides insight into the mechanisms of fungal pathogenicity, as well as potential therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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