High Throughput Screeening of Flax (Linum usitatissimum L.) Cyclolinopeptides
Notice bibliographique
Résumé
Flax (Linum usitatissimum L.) seed is a rich source of potentially valuable cyclic peptides (CLs). The current research investigated the genotypic and environmental variation of CLs expressed in the Flax World Core Collection by means of high-throughput extraction and rapid HPLC analysis. The collection is a representative subsample of the widest diversity of flax gene resources. The performance of monolithic and microparticulate HPLC columns were compared for their efficiency in rapid reversed phase liquid chromatographic separation of CLs. CL analysis time was reduced to 1.5 min at a flow rate of 3.0 mL•min-1 using a monolithic Chromolith® SpeedROD. The column performed over 2000 injections without measurable changes in performance under these conditions. The optimum extraction conditions of CLs were also established. Total CL content was proportional to sum of UV absorbance (mAU) of the observed peptide chromatographic peaks at 214 nm. The total mAU of samples extracts from core collection samples planted in Saskatoon ranged from 71.4 to 223.7 mAU with a mean value of 153.5 ± 24.3 mAU ( + SD), whereas the total mAU from samples grown at the Morden site ranged from 96.2 to 243.6 mAU with a mean value of 171.3 ± 24.0 mAU. The highest total CL content was observed in cultivar ‘AC Watson’, whereas, ‘Primus’ and an unnamed accession (CN 101580, TMP 10121) exhibited the highest ratio CLs expressed by NCBI gene sequence AFSQ01016651.1 to peptides expressed by gene sequence AFSQ01025165.1. In contrast, the lowest total CL content and ratio of these gene products was observed in ‘Hollandia’ and ‘Z 11637’. No correlation between CL content and plant height, stem branching, petal colour, seed colour, seed weight, seed oil content, or α-linolenic content was evident. In addition to the known peptides, novel peptides 1-Met-CLN, 1-Mso-CLN, and 1-Msn-CLN were identified from ‘Hollandia’ and ‘Z 11637’. The variation of CL content and composition of flaxseed from the core collection reveals that genetics may benefit flax breeding programs by allowing the selection of flax accessions with improved composition and functional properties.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».