MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1501740227 · doi:10.1111/j.1471-4159.2010.07005.x

PACAP‐regulated phenylethanolamine<i>N</i>‐methyltransferase gene expression

2010· article· en· W1501740227 sur OpenAlexaff
T.C. Tai, David C. Wong‐Faull, Robert Claycomb, Jennifer L. Aborn, Dona L. Wong

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuropeptides and Animal Physiology
Établissements canadiensNOSM UniversityLaurentian University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyPhenylethanolamine N-methyltransferasePituitary adenylate cyclase-activating peptideBiologyActivator (genetics)Protein kinase APromoterPhenylethanolamineMessenger RNAReceptorChemistryGene expressionGeneKinaseCell biologyBiochemistryEnzymeNeuropeptideVasoactive intestinal peptideTyrosine hydroxylase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pituitary adenylate cyclase activating polypeptide (PACAP) induces the proximal -893 bp of rat phenylethanolamine N-methyltransferase (PNMT) gene promoter in PC12 cells via PACAP type I receptors. Deletion mutation analysis suggested that the initial -392 bp of promoter, containing early growth response protein (Egr-1), specificity protein 1 (Sp1) and activator protein 2 (AP-2) binding sites (-165, -168 and -103 bp, respectively), was sufficient for PACAP activation. Egr-1 and AP-2 involvement was supported by PACAP induction of their mRNA and protein. Mutation of the Egr-1, Sp1 and AP-2 elements showed that the Egr-1 site was essential for PACAP stimulation. Mutation of the -103 bp AP-2 site partially reduced PACAP activation of the promoter. Mutation of two upstream AP-2 sites at -573 and -650 bp, separately or in tandem, also prevented promoter induction by PACAP. siRNA knock-down of Egr-1 and AP-2 suppressed promoter activation for the -893 bp construct. Egr-1 siRNA knock-down also eliminated the residual activation observed for the -103 bp AP-2 mutant construct, suggesting that Egr-1 and AP-2 through respective -165 and -650/-573/-103 bp sites cooperatively stimulate the promoter. PACAP responses appear orchestrated through cAMP-protein kinase A and phospholipase C signaling as MDL12,330A, H89 and U73122, respectively, inhibited promoter induction by PACAP and reduced PACAP-stimulation of Egr-1, AP-2 and PNMT mRNA and protein and Egr-1 and AP-2 protein/DNA complex formation. Findings are the first to show that PACAP stimulates PNMT promoter-driven gene expression via PACAP type I receptors and cAMP-protein kinase A and phospholipase C signaling, recruiting Egr-1 and AP-2 as cooperative regulators, and the first to associate the transcription factor AP-2 to PACAP-mediated gene induction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of NeurochemistryMême sujetNeuropeptides and Animal PhysiologyTravaux en français237 207