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Enregistrement W1502476404 · doi:10.1186/s12916-015-0396-2

A meta-analysis of the performance of the PimaTM CD4 for point of care testing

2015· review· en· W1502476404 sur OpenAlexfundno aff
Lesley Scott, Jennifer Campbell, Larry E. Westerman, Luc Kestens, Lara Vojnov, Luciana Kohastsu, John N. Nkengasong, Trevor Peter, Wendy Stevens

Notice bibliographique

RevueBMC Medicine · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS Research and Interventions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionGrand Challenges CanadaU.S. President’s Emergency Plan for AIDS Relief
Mots-clésMedicineConfidence intervalPoint-of-care testingBivariate analysisInternal medicinePoint of careMean differenceMeta-analysisUnivariate analysisImmunologyStatisticsPathologyMultivariate analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Alere point-of-care (POC) Pima™ CD4 analyzer allows for decentralized testing and expansion to testing antiretroviral therapy (ART) eligibility. A consortium conducted a pooled multi-data technical performance analysis of the Pima CD4. METHODS: Primary data (11,803 paired observations) comprised 22 independent studies between 2009-2012 from the Caribbean, Asia, Sub-Saharan Africa, USA and Europe, using 6 laboratory-based reference technologies. Data were analyzed as categorical (including binary) and numerical (absolute) observations using a bivariate and/or univariate random effects model when appropriate. RESULTS: At a median reference CD4 of 383 cells/μl the mean Pima CD4 bias is -23 cells/μl (average bias across all CD4 ranges is 10 % for venous and 15% for capillary testing). Sensitivity of the Pima CD4 is 93% (95% confidence interval [CI] 91.4% - 94.9%) at 350 cells/μl and 96% (CI 95.2% - 96.9%) at 500 cells/μl, with no significant difference between venous and capillary testing. Sensitivity reduced to 86% (CI 82% - 89%) at 100 cells/μl (for Cryptococcal antigen (CrAg) screening), with a significant difference between venous (88%, CI: 85% - 91%) and capillary (79%, CI: 73% - 84%) testing. Total CD4 misclassification is 2.3% cases at 100 cells/μl, 11.0% at 350 cells/μl and 9.5 % at 500 cells/μl, due to higher false positive rates which resulted in more patients identified for treatment. This increased by 1.2%, 2.8% and 1.8%, respectively, for capillary testing. There was no difference in Pima CD4 misclassification between the meta-analysis data and a population subset of HIV+ ART naïve individuals, nor in misclassification among operator cadres. The Pima CD4 was most similar to Beckman Coulter PanLeucogated CD4, Becton Dickinson FACSCalibur and FACSCount, and less similar to Partec CyFlow reference technologies. CONCLUSIONS: The Pima CD4 may be recommended using venous-derived specimens for screening (100 cells/μl) for reflex CrAg screening and for HIV ART eligibility at 350 cells/μl and 500 cells/μl thresholds using both capillary and venous derived specimens. These meta-analysis findings add to the knowledge of acceptance criteria of the Pima CD4 and future POC tests, but implementation and impact will require full costing analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,031
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,068
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0310,068
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,053
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,436
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,040 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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