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Enregistrement W1506241819 · doi:10.5772/33005

Association Mapping in Plant Genomes

2012· book-chapter· en· W1506241819 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInTech eBooks · 2012
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAssociation (psychology)BiologyComputational biologyGenome-wide association studyGenomeGeographyEvolutionary biologyGeneticsPsychologySingle-nucleotide polymorphismGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the many goals of plant geneticists and breeders pertains to the explanation of phenotypic variation as it relates to changes in DNA sequence (Myles et al., 2009). The development of molecular markers for the detection and exploitation of DNA polymorphisms in plant systems is one of the most significant developments in the field of molecular biology and biotechnology. Linkage mapping has been a key tool for identifying the genetic basis of quantitative traits in plants. However, for linkage studies, suitable crosses, sometimes limited by low polymorphism or small population size, are required. In addition, only two alleles per locus and few recombination events are considered to estimate the genetic distances between marker loci and to identify the causative genomic regions for quantitative trait loci (QTL), thereby limiting the mapping resolution. To circumvent these limitations, linkage disequilibrium (LD) mapping or association mapping (AM) has been used extensively to dissect human diseases (Slatkin, 2008). This approach has received increased attention during the last few years. AM has the potential to identify a single polymorphism within a gene that is responsible for phenotypic differences. AM involves searching for genotype-phenotype correlations among unrelated individuals. Its high resolution is accounted for by the historical recombination accumulated in natural populations and collections of landraces, breeding materials and varieties. By exploiting broader genetic diversity, AM offers three main advantages over linkage mapping: mapping resolution, allele number and time saving in establishing a marker-trait association and its application in a breeding program (Flint-Garcia et al., 2003). Although AM presents clear advantages over linkage mapping, they are often applied in conjunction, especially to validate the associations identified by AM, thus reducing spurious associations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,830

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle