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Enregistrement W1514282208 · doi:10.1002/0471142735.im0318s71

In Vitro Systems for the Study of T Cell Development: Fetal Thymus Organ Culture and OP9‐DL1 Cell Coculture

2006· article· en· W1514282208 sur OpenAlexaff
Fred Ramsdell, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker, Yousuke Takahama

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols in Immunology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiomedical and Engineering Education
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesUniversity of Tokushima
Mots-clésBiologyCell biologyImmunologyHaematopoiesisIn vitroT cellProgenitor cellCell cultureOrgan cultureFetusStem cellImmune systemBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most T cell development occurs within the thymus and includes a series of selection processes that are, in large part, still poorly understood. Studies of T cell development have been greatly advanced by the description of multiple phenotypic subsets of T cells and their maturational relationships. This unit describes a system for observing and modulating T cell development in vitro via the culture of entire mouse fetal thymic lobes. Methods are included for the isolation of fetal thymi and culture to allow for normal T cell development on either transwell plates or Gelfoam sponges. A method for depleting hematopoietic cells from thymic lobes using 2'-deoxyguanosine and subsequent reconstitution with precursor cells is also described. This protocol is valuable for the study of tolerance and T cell selection. A support protocol describing methods of altering and monitoring T cell development are outlined. In addition, methods for culturing fetal thymic lobes under high oxygen submersion conditions and for the preparation of reaggregate thymus organ cultures are provided. Finally, a simple and practical method that allows for the thymus-independent generation of T cells from defined sources of stem/progenitor cells by OP9-DL1 coculture is described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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