<scp><i>A</i></scp><i>cinetobacter</i> strains carry two functional oligosaccharyltransferases, one devoted exclusively to type <scp>IV</scp> pilin, and the other one dedicated to <scp><i>O</i></scp>‐glycosylation of multiple proteins
Notice bibliographique
Résumé
Multiple species within the Acinetobacter genus are nosocomial opportunistic pathogens of increasing relevance worldwide. Among the virulence factors utilized by these bacteria are the type IV pili and a protein O-glycosylation system. Glycosylation is mediated by O-oligosaccharyltransferases (O-OTases), enzymes that transfer the glycan from a lipid carrier to target proteins. O-oligosaccharyltransferases are difficult to identify due to similarities with the WaaL ligases that catalyze the last step in lipopolysaccharide synthesis. A bioinformatics analysis revealed the presence of two genes encoding putative O-OTases or WaaL ligases in most of the strains within the genus Acinetobacter. Employing A. nosocomialis M2 and A. baylyi ADP1 as model systems, we show that these genes encode two O-OTases, one devoted uniquely to type IV pilin, and the other one responsible for glycosylation of multiple proteins. With the exception of ADP1, the pilin-specific OTases in Acinetobacter resemble the TfpO/PilO O-OTase from Pseudomonas aeruginosa. In ADP1 instead, the two O-OTases are closely related to PglL, the general O-OTase first discovered in Neisseria. However, one of them is exclusively dedicated to the glycosylation of the pilin-like protein ComP. Our data reveal an intricate and remarkable evolutionary pathway for bacterial O-OTases and provide novel tools for glycoengineering.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».