Rab7 and Arl8 <scp>GTPases</scp> are Necessary for Lysosome Tubulation in Macrophages
Notice bibliographique
Résumé
Lysosomes provide a niche for molecular digestion and are a convergence point for endocytic trafficking, phagosome maturation and autophagy. Typically, lysosomes are small, globular organelles that appear punctate under the fluorescence microscope. However, activating agents like phorbol esters transform macrophage lysosomes into tubular lysosomes (TLs), which have been implicated in retention of pinocytic uptake and phagosome maturation. Moreover, dendritic cells exposed to lipopolysaccharides (LPSs) convert their punctate class II major histocompatibility complex compartment, a lysosome-related organelle, into a tubular network that is thought to be involved in antigen presentation. Other than a requirement for microtubules and kinesin, little is known about the molecular mechanisms that drive lysosome tubulation. Here, we show that macrophage cell lines readily form TLs after LPS exposure, with a requirement for the Rab7 GTPase and its effectors RILP (Rab7-interacting lysosomal protein) and FYCO1 (coiled-coil domain-containing protein 1), which respectively modulate the dynein and kinesin microtubule motor proteins. We also show that Arl8B, a recently identified lysosomal GTPase, and its effector SKIP, are also important for TL biogenesis. Finally, we reveal that TLs are significantly more motile than punctate lysosomes within the same LPS-treated cells. Therefore, we identify the first molecular regulators of lysosome tubulation and we show that TLs represent a more dynamic lysosome population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».