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Enregistrement W1521669849 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.606.7

Role of membrane contact sites in PM ‐ ER sterol transport (606.7)

2014· article· en· W1521669849 sur OpenAlexaff
Yves Y. Sere, Jesper Johansen, Christopher Beh, Anant K. Menon

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumSterolSaccharomyces cerevisiaeLipid dropletCytoplasmCell biologyOrganelleErgosterolMembraneMembrane contact siteYeastChemistryVesicular transport proteinBiochemistryBiologyBiophysicsMembrane proteinVesicleCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intracellular trafficking of sterols occurs largely by non‐vesicular processes that are poorly understood. Cytoplasmic sterol transport proteins (STPs) are presumed to ferry sterols between membranes and this may be enhanced in regions where the participating membranes are closely apposed (membrane contact sites or MCSs). The major sterol trafficking pathway in the yeast Saccharomyces cerevisiae involves direct transfer between the endoplasmic reticulum (ER) and plasma membrane (PM). Yeast STPs have not been identified, although the cytoplasmic protein Kes1/Osh4 has been implicated in the phosphoinositide‐driven cycling of ergosterol between the ER and TGN. We considered whether MCSs between the ER and PM might play a role in sterol transport between the two organelles. We tested this hypothesis by analyzing sterol traffic in Saccharomyces cerevisiae cells that were largely devoid of ER ‐ PM contact sites (∆tether cells). We used fluorescence microscopy to track the retrograde movement of exogenously supplied dehydroergosterol (DHE) from the PM to the ER and lipid droplets, and high performance liquid chromatography to quantify, in parallel, the transport‐coupled formation of DHE esters. We found that sterol transport from PM to ER is unaffected in ∆tether cells. We are currently generating strains based on ∆tether cells in which all residual ER‐PM MCSs are eliminated, and also testing whether vesicular pathways might play a redundant role in the absence of MCSs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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