A genomewide association mapping study using ultrasound‐scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to identify candidate genes and genomic regions associated with ultrasound-derived measurements of the rib-eye area (REA), backfat thickness (BFT) and rumpfat thickness (RFT) in Nellore cattle. Data from 640 Nellore steers and young bulls with genotypes for 290 863 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were used for genomewide association mapping. Significant SNP associations were explored to find possible candidate genes related to physiological processes. Several of the significant markers detected were mapped onto functional candidate genes including ARFGAP3, CLSTN2 and DPYD for REA; OSBPL3 and SUDS3 for BFT; and RARRES1 and VEPH1 for RFT. The physiological pathway related to lipid metabolism (CLSTN2, OSBPL3, RARRES1 and VEPH1) was identified. The significant markers within previously reported QTLs reinforce the importance of the genomic regions, and the other loci offer candidate genes that have not been related to carcass traits in previous investigations.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle