Association of Filaggrin (FLG) Gene Polymorphism with Canine Atopic Dermatitis in Small Breed Dogs
Notice bibliographique
Résumé
As a cornified envelope protein, filaggrin (FLG) is involved in the formation and support of the skin barrier.FLG single nucleotide polymorphism (SNP) at the position 64,297,022 (rs22588227) on canine chromosome 17 hasinitially been described as being associated with canine atopic dermatitis (CAD) in Labrador Retrievers in UK. In thisstudy, we have examined whether the mentioned FLG SNP is associated with a susceptibility to CAD in small breeddogs, comprising 21 Poodles, 17 Shih tzus and 3 Pugs. Twelve of these subjects were dogs with atopy and wereassigned to the experiment group and the remaining 39 samples were healthy controls. The results showed nodifference of the allele frequencies at the above-mentioned position between dogs with atopic dermatitis and thecontrols. However, this study assessed a naturally observed sequence diversity of FLG in the dog, identifying 13 newSNPs within canine FLG and a novel repeated sequence of FLG which had not appeared in dog genome databases.Allele frequencies demonstrated that 2 of the 13 novel observed polymorphisms at the locations 64,297,000 (p = 0.041,odds ratio = 3.920) and 64,297,126 (p = 0.043, odds ratio = 3.706) were plausibly associated with a susceptibility toCAD. The effect of all SNPs was dependent on one another with a strong linkage disequilibrium (D’≥0.89) in onehaplotype block (frequencies ≥2%). This study suggests a role of FLG polymorphisms in CAD and also demonstratesthe successful attempts to identify another unique fragment of the repeated FLG sequence and the novel SNPs.However, since small population was included in this study, the study should be repeated with a larger population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».