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Enregistrement W1534021127 · doi:10.1002/0470028637.met160

The Ferric Hydroxamate Uptake Receptor<scp>Fhu</scp><scp>A</scp>and Related<scp>Ton</scp><scp>B</scp>‐Dependent Transporters in the Outer Membrane of Gram‐Negative Bacteria

2004· other· en· W1534021127 sur OpenAlexaff
Andrew D. Ferguson, James W. Coulton, Kay Diederichs, Wolfram Welte

Notice bibliographique

RevueHandbook of Metalloproteins · 2004
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterial outer membraneFerrichromeColicinEnterobactinEscherichia coliATP-binding cassette transporterBiochemistryPeriplasmic spaceChemistryBiologyTransporter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract FhuA, receptor for ferrichrome‐iron in Escherichia coli , is a member of a family of integral outer membrane proteins, which together with the energy transducing TonB–ExbB–ExbD complex of the cytoplasmic membrane, mediate active transport of siderophores, Vitamin B12, and heme across the outer membrane of gram‐negative bacteria. In addition to transporting ferrichrome, FhuA acts as the primary receptor for several bacteriophages, the antibiotics albomycin and rifamycin CGP 4832, the cyclic peptide antibiotic microcin J25, and the bacterial toxin, colicin M. FhuA is a β‐barrel composed of 22 antiparallel β‐strands. Located within the β‐barrel is a structurally distinct domain, the ’cork’, consisting mainly of a four‐stranded β‐sheet and four short α‐helices. The focus of this review is an analysis of the relationship between the three‐dimensional structure of FhuA and its biological function as an energy‐dependent outer membrane transporter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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